210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL04770 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  100 
 
 		 952 aa  1966    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  37.89 
 
 		 466 aa  262  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  33.33 
 
 		 797 aa  246  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  34.83 
 
 		 479 aa  239  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  33.13 
 
 		 1090 aa  235  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  33.15 
 
 		 754 aa  231  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  39.1 
 
 		 388 aa  230  9e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  33.19 
 
 		 1077 aa  229  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  33.94 
 
 		 655 aa  225  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  31.26 
 
 		 636 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  34 
 
 		 622 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  35.12 
 
 		 650 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  34.93 
 
 		 650 aa  213  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  31.25 
 
 		 632 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  33.78 
 
 		 622 aa  210  9e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  33.12 
 
 		 636 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  33.26 
 
 		 619 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  31.5 
 
 		 643 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  31.48 
 
 		 635 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  30.65 
 
 		 609 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  31.26 
 
 		 1999 aa  194  5e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  39.93 
 
 		 268 aa  192  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  30.53 
 
 		 611 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  32.82 
 
 		 651 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  31.43 
 
 		 633 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  31.55 
 
 		 633 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  30.88 
 
 		 633 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  28.69 
 
 		 716 aa  169  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  28.74 
 
 		 2245 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  29.39 
 
 		 633 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  27.8 
 
 		 748 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.31 
 
 		 752 aa  165  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  29.68 
 
 		 464 aa  166  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  29.12 
 
 		 715 aa  160  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  28.67 
 
 		 686 aa  156  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  29.96 
 
 		 902 aa  153  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  28.63 
 
 		 934 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  27.81 
 
 		 1048 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  31.07 
 
 		 553 aa  141  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  31.07 
 
 		 553 aa  141  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  28.33 
 
 		 1097 aa  140  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  29.22 
 
 		 901 aa  135  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  30.67 
 
 		 1189 aa  135  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  25.99 
 
 		 795 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  32.25 
 
 		 941 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  32.9 
 
 		 315 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.92 
 
 		 986 aa  132  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  26.28 
 
 		 486 aa  127  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  25.64 
 
 		 585 aa  125  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.67 
 
 		 629 aa  125  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.42 
 
 		 1099 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  27.17 
 
 		 902 aa  122  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.06 
 
 		 2310 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1018 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.43 
 
 		 606 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  28.7 
 
 		 1653 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  26.22 
 
 		 1585 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  26.22 
 
 		 1585 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  28.25 
 
 		 1038 aa  98.6  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  31.98 
 
 		 237 aa  97.8  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  25.53 
 
 		 759 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  24.76 
 
 		 769 aa  96.3  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.93 
 
 		 1620 aa  96.3  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  25.1 
 
 		 521 aa  95.9  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  24.8 
 
 		 759 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.11 
 
 		 759 aa  95.5  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  25.32 
 
 		 759 aa  95.1  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  25.65 
 
 		 759 aa  94.4  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  25.65 
 
 		 759 aa  94.4  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  24.89 
 
 		 759 aa  94.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  24.52 
 
 		 759 aa  93.6  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  35.09 
 
 		 219 aa  94.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  24.89 
 
 		 759 aa  93.6  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 1175 aa  93.2  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25 
 
 		 769 aa  92.8  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  28.79 
 
 		 283 aa  92.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  22.92 
 
 		 1284 aa  92.4  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  25.88 
 
 		 1108 aa  86.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  25.11 
 
 		 1270 aa  85.1  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1126 aa  84.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  25.09 
 
 		 1403 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  24.5 
 
 		 1126 aa  82  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  28.35 
 
 		 1651 aa  81.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.47 
 
 		 1428 aa  81.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  25.25 
 
 		 1427 aa  79.7  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  25.29 
 
 		 1284 aa  78.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.27 
 
 		 1111 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  26.17 
 
 		 1041 aa  75.5  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  26.99 
 
 		 944 aa  75.1  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  26.01 
 
 		 1408 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  23.53 
 
 		 1136 aa  73.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  26.83 
 
 		 1422 aa  71.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  23.6 
 
 		 1198 aa  71.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  25.16 
 
 		 2098 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  25.16 
 
 		 2098 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  26.55 
 
 		 1622 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  23.06 
 
 		 1261 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1139 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  27.27 
 
 		 1212 aa  70.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1116 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>