149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2280 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  44.84 
 
 		 1427 aa  1151    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  36.11 
 
 		 1457 aa  813    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  100 
 
 		 1403 aa  2868    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  28.63 
 
 		 1261 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  29.54 
 
 		 1271 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  30.26 
 
 		 1255 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  29.61 
 
 		 1408 aa  146  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.41 
 
 		 1428 aa  142  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1275 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1259 aa  133  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.54 
 
 		 606 aa  95.5  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25.09 
 
 		 952 aa  82.8  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.71 
 
 		 629 aa  82.8  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  24.38 
 
 		 748 aa  82.4  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  26.36 
 
 		 902 aa  81.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.88 
 
 		 1048 aa  80.5  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  25.53 
 
 		 1090 aa  79.7  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  25.61 
 
 		 902 aa  79.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  25.72 
 
 		 986 aa  79.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  24.8 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.96 
 
 		 1038 aa  77.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  25.5 
 
 		 934 aa  77.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1126 aa  75.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1139 aa  75.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  24.83 
 
 		 1163 aa  75.1  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  24.48 
 
 		 1584 aa  73.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  27.32 
 
 		 941 aa  72.8  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.24 
 
 		 1077 aa  70.5  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  23.8 
 
 		 716 aa  69.7  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.07 
 
 		 636 aa  69.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  24.18 
 
 		 633 aa  69.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.61 
 
 		 932 aa  69.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  28.05 
 
 		 754 aa  68.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.34 
 
 		 636 aa  68.6  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  26.2 
 
 		 901 aa  68.6  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.18 
 
 		 635 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  23.31 
 
 		 633 aa  67  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  24.52 
 
 		 797 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.44 
 
 		 752 aa  67  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  27.09 
 
 		 946 aa  67  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  24.41 
 
 		 609 aa  66.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  23.69 
 
 		 486 aa  66.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30 
 
 		 1324 aa  66.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  23.11 
 
 		 1111 aa  65.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.73 
 
 		 1196 aa  65.1  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1116 aa  65.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  25.19 
 
 		 650 aa  64.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.07 
 
 		 633 aa  63.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25.58 
 
 		 655 aa  63.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  29.26 
 
 		 2002 aa  63.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1215 aa  63.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  24.68 
 
 		 650 aa  63.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  23.56 
 
 		 1143 aa  63.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  23.56 
 
 		 1143 aa  63.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  23.99 
 
 		 922 aa  62.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1247 aa  62.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  27.33 
 
 		 1250 aa  62  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  27.18 
 
 		 388 aa  61.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  24.95 
 
 		 1082 aa  61.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  23.73 
 
 		 1143 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1822 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  24.17 
 
 		 643 aa  60.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  25.67 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  25.43 
 
 		 1196 aa  58.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  23.65 
 
 		 521 aa  58.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.85 
 
 		 622 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  25.16 
 
 		 1651 aa  57.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.95 
 
 		 925 aa  57.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  21.7 
 
 		 1284 aa  57.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  23.8 
 
 		 759 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  23.59 
 
 		 759 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  24.18 
 
 		 1697 aa  56.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  24.94 
 
 		 2198 aa  56.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  25.71 
 
 		 758 aa  56.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.38 
 
 		 759 aa  56.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  27.85 
 
 		 619 aa  56.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  26.43 
 
 		 903 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.21 
 
 		 769 aa  56.2  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  28.52 
 
 		 622 aa  56.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  23.75 
 
 		 759 aa  55.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.82 
 
 		 1986 aa  56.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  35.71 
 
 		 1151 aa  55.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  24.17 
 
 		 633 aa  55.5  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  23.17 
 
 		 759 aa  55.5  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  23.17 
 
 		 759 aa  55.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  23.17 
 
 		 759 aa  55.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  27.22 
 
 		 1958 aa  55.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.2 
 
 		 759 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  26.9 
 
 		 1950 aa  54.3  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  27.92 
 
 		 315 aa  54.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  26.69 
 
 		 686 aa  53.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  24.2 
 
 		 759 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  22.73 
 
 		 632 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1018 aa  53.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  24.42 
 
 		 769 aa  54.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  23.4 
 
 		 1629 aa  53.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  22.88 
 
 		 611 aa  53.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  29.38 
 
 		 659 aa  53.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  23.27 
 
 		 916 aa  52.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.59 
 
 		 585 aa  52.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>