217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI01000 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  100 
 
 		 748 aa  1527    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  37.52 
 
 		 686 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  33.86 
 
 		 716 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  34.05 
 
 		 609 aa  334  5e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  30.25 
 
 		 655 aa  284  4.0000000000000003e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  32.25 
 
 		 650 aa  268  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  31.85 
 
 		 650 aa  266  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  30.31 
 
 		 754 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  34.28 
 
 		 622 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  34.35 
 
 		 619 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  28.87 
 
 		 632 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  33.47 
 
 		 622 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  28.77 
 
 		 636 aa  246  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  33.02 
 
 		 633 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  28.89 
 
 		 635 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  30.84 
 
 		 633 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  31.34 
 
 		 633 aa  237  7e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  28.17 
 
 		 636 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  33.14 
 
 		 651 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  32.9 
 
 		 643 aa  233  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  27.79 
 
 		 611 aa  228  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  28.76 
 
 		 633 aa  226  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  30.73 
 
 		 466 aa  196  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  30.2 
 
 		 464 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  29.88 
 
 		 1090 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  27.99 
 
 		 1999 aa  179  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  29.14 
 
 		 797 aa  177  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  29.94 
 
 		 1077 aa  174  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  27.8 
 
 		 952 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  29.12 
 
 		 479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  40.08 
 
 		 237 aa  164  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  26.87 
 
 		 1048 aa  158  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  26.64 
 
 		 902 aa  156  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  26.38 
 
 		 2245 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  26.51 
 
 		 986 aa  150  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  26.56 
 
 		 1097 aa  141  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  31.4 
 
 		 388 aa  135  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.75 
 
 		 752 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  27.49 
 
 		 795 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  31.21 
 
 		 902 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  26.97 
 
 		 715 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.29 
 
 		 629 aa  128  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  29.03 
 
 		 941 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  26.65 
 
 		 553 aa  127  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  26.65 
 
 		 553 aa  127  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  31.55 
 
 		 268 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  30.55 
 
 		 934 aa  124  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.77 
 
 		 1099 aa  122  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1018 aa  121  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  29.62 
 
 		 901 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  29.62 
 
 		 1653 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  29.28 
 
 		 606 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  30.89 
 
 		 315 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  29.04 
 
 		 1620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  26.95 
 
 		 1108 aa  112  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  27.59 
 
 		 1585 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  27.59 
 
 		 1585 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  25.1 
 
 		 486 aa  108  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.9 
 
 		 585 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  27.86 
 
 		 1189 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  30.04 
 
 		 283 aa  96.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  26.74 
 
 		 1175 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  23.3 
 
 		 1651 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.51 
 
 		 769 aa  88.2  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  23.37 
 
 		 759 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  23.37 
 
 		 759 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  23.08 
 
 		 759 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  23.37 
 
 		 759 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  23.58 
 
 		 759 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.37 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  24.38 
 
 		 1403 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  23.37 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  27.74 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  25.77 
 
 		 1284 aa  81.3  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  23.88 
 
 		 759 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 		 2310 aa  80.5  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  22.97 
 
 		 769 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  25.24 
 
 		 1457 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  26.17 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1275 aa  78.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  22.97 
 
 		 759 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.13 
 
 		 1196 aa  78.2  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  26.56 
 
 		 944 aa  77.4  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.37 
 
 		 1038 aa  76.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  24.73 
 
 		 1427 aa  76.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  21.72 
 
 		 1212 aa  75.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  24.09 
 
 		 1190 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1116 aa  72.4  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  26.04 
 
 		 1980 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1259 aa  71.2  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  28.04 
 
 		 1190 aa  69.3  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  27.65 
 
 		 1185 aa  69.7  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  24.85 
 
 		 1284 aa  67.8  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1126 aa  67  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  25.08 
 
 		 1126 aa  67.4  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1722 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  24.86 
 
 		 2002 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  22.73 
 
 		 1427 aa  66.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.44 
 
 		 1986 aa  65.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  23.32 
 
 		 1255 aa  65.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>