168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4606 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1284 aa  2631    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  36.83 
 
 		 1284 aa  267  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  28.35 
 
 		 1653 aa  181  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  28.71 
 
 		 1585 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  28.71 
 
 		 1585 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  27.25 
 
 		 585 aa  109  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.22 
 
 		 1099 aa  108  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  27.05 
 
 		 1108 aa  99.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  31.07 
 
 		 1651 aa  97.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  27.3 
 
 		 1620 aa  97.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  27.89 
 
 		 1090 aa  96.3  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  29.02 
 
 		 797 aa  94.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  27.73 
 
 		 1077 aa  94  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  26.39 
 
 		 643 aa  94  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  27.83 
 
 		 1126 aa  91.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1018 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  27.14 
 
 		 754 aa  89.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  25.27 
 
 		 650 aa  87.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  25.27 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  27.27 
 
 		 941 aa  84  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  28.29 
 
 		 716 aa  82.4  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  27.09 
 
 		 715 aa  82  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  28.02 
 
 		 1175 aa  81.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  25.74 
 
 		 611 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  27.79 
 
 		 466 aa  81.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25.86 
 
 		 952 aa  80.9  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.93 
 
 		 752 aa  80.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  40.91 
 
 		 633 aa  79.3  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  42.57 
 
 		 1048 aa  77  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  26.29 
 
 		 1212 aa  77.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  38.2 
 
 		 633 aa  74.3  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  31.65 
 
 		 686 aa  73.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  27.24 
 
 		 2245 aa  73.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  38.2 
 
 		 633 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  25.37 
 
 		 748 aa  73.6  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  30.19 
 
 		 609 aa  73.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  24.37 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  25.57 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  30.84 
 
 		 622 aa  72  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  29.47 
 
 		 1523 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  38.71 
 
 		 655 aa  71.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.27 
 
 		 629 aa  70.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  35.96 
 
 		 633 aa  71.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  25.15 
 
 		 388 aa  71.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  29.87 
 
 		 651 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  26.56 
 
 		 1190 aa  70.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  42.35 
 
 		 622 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  44.44 
 
 		 619 aa  69.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.51 
 
 		 1999 aa  69.3  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  46.15 
 
 		 986 aa  68.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  26.65 
 
 		 1097 aa  68.6  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  27.97 
 
 		 1111 aa  68.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2944  serine/threonine kinase protein  36.42 
 
 		 762 aa  68.6  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  39.02 
 
 		 486 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  46.97 
 
 		 464 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  28.82 
 
 		 934 aa  67.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.35 
 
 		 902 aa  66.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  28.39 
 
 		 1189 aa  65.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  50.75 
 
 		 902 aa  65.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25.08 
 
 		 636 aa  65.1  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 636 aa  64.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  24.37 
 
 		 925 aa  61.6  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  26.64 
 
 		 1575 aa  61.6  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  39.29 
 
 		 635 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  26.25 
 
 		 795 aa  60.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  41.86 
 
 		 901 aa  60.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  23.72 
 
 		 632 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1062 aa  60.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.84 
 
 		 254 aa  59.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  25 
 
 		 905 aa  59.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25 
 
 		 905 aa  58.9  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  26.18 
 
 		 946 aa  58.9  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  24.47 
 
 		 1408 aa  58.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  22.87 
 
 		 2310 aa  58.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  22.73 
 
 		 1171 aa  57.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.22 
 
 		 1203 aa  58.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  25.48 
 
 		 553 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  25.48 
 
 		 553 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.32 
 
 		 1038 aa  57.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  25.16 
 
 		 1861 aa  57.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  24.48 
 
 		 944 aa  56.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 		 1196 aa  57  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  25.83 
 
 		 908 aa  56.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.39 
 
 		 922 aa  55.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  29.57 
 
 		 1041 aa  55.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  24.44 
 
 		 907 aa  54.3  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  22.45 
 
 		 1056 aa  55.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  23.48 
 
 		 1557 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  25.55 
 
 		 2759 aa  54.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1822 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  32.99 
 
 		 914 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  41.67 
 
 		 2123 aa  53.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  23.89 
 
 		 1559 aa  53.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  31.13 
 
 		 268 aa  52.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  30.63 
 
 		 1271 aa  52.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  24.52 
 
 		 900 aa  52.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  25.08 
 
 		 1489 aa  52  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1724 aa  52  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.8 
 
 		 916 aa  52  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  23.59 
 
 		 1427 aa  51.6  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>