166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4194 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  100 
 
 		 1126 aa  2302    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  32.57 
 
 		 1108 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  30.65 
 
 		 1653 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  30.09 
 
 		 1585 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  30.09 
 
 		 1585 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  31.13 
 
 		 1620 aa  111  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  30.37 
 
 		 941 aa  110  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  29.18 
 
 		 1284 aa  107  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  30.57 
 
 		 1099 aa  106  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  28.66 
 
 		 585 aa  97.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1018 aa  95.9  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  29.49 
 
 		 1651 aa  95.1  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.24 
 
 		 632 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  24.69 
 
 		 643 aa  94.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  24.63 
 
 		 650 aa  92.4  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  24.63 
 
 		 650 aa  91.7  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  25.53 
 
 		 902 aa  91.3  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.29 
 
 		 635 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  26.57 
 
 		 1284 aa  89.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  25.41 
 
 		 934 aa  87.4  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  24.3 
 
 		 1212 aa  85.9  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  28.06 
 
 		 629 aa  85.9  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  25.89 
 
 		 479 aa  85.9  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  25.63 
 
 		 715 aa  83.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  26.13 
 
 		 606 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.54 
 
 		 986 aa  82  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  24.5 
 
 		 952 aa  81.6  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.47 
 
 		 636 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  26.98 
 
 		 2245 aa  80.9  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25.08 
 
 		 636 aa  80.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  27.72 
 
 		 1077 aa  79.7  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  24.34 
 
 		 797 aa  79.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  25.21 
 
 		 754 aa  79.3  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  24.85 
 
 		 655 aa  79  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  26.86 
 
 		 902 aa  79  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  27.72 
 
 		 1090 aa  78.6  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.19 
 
 		 752 aa  78.2  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  28.85 
 
 		 901 aa  78.2  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.55 
 
 		 609 aa  77  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  27.19 
 
 		 521 aa  77.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  23.61 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  26.71 
 
 		 1137 aa  75.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  27.18 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  26.86 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  25.57 
 
 		 1190 aa  71.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  24.85 
 
 		 716 aa  70.1  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  23.51 
 
 		 633 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  23.43 
 
 		 925 aa  70.1  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  28.52 
 
 		 553 aa  69.7  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  28.52 
 
 		 553 aa  69.7  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2944  serine/threonine kinase protein  26.26 
 
 		 762 aa  69.7  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1139 aa  68.6  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  25.62 
 
 		 611 aa  67.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  24.09 
 
 		 486 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  25.08 
 
 		 748 aa  67.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  22.67 
 
 		 1999 aa  66.6  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  24.54 
 
 		 297 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  22.77 
 
 		 906 aa  66.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  26.1 
 
 		 622 aa  66.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  26.4 
 
 		 1189 aa  65.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.38 
 
 		 1038 aa  66.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  24.75 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  24.34 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  25.84 
 
 		 651 aa  65.1  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  25.42 
 
 		 619 aa  64.7  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1118 aa  64.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1126 aa  64.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  25.42 
 
 		 622 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.54 
 
 		 1082 aa  64.3  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.67 
 
 		 1428 aa  64.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  24.44 
 
 		 1121 aa  64.3  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.21 
 
 		 1048 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  24.29 
 
 		 633 aa  63.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.12 
 
 		 1196 aa  63.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.66 
 
 		 254 aa  63.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.85 
 
 		 1250 aa  62  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1172 aa  62  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  28.69 
 
 		 1694 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  23.79 
 
 		 946 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.5 
 
 		 1203 aa  61.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  24.76 
 
 		 759 aa  60.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  25.17 
 
 		 1408 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  30.3 
 
 		 1143 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1116 aa  60.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  30.3 
 
 		 1143 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.44 
 
 		 759 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  24.28 
 
 		 795 aa  59.3  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  25.86 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  25.52 
 
 		 914 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  24.68 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  24.12 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  24.44 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  23.98 
 
 		 1175 aa  58.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  24.53 
 
 		 1489 aa  58.2  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  37.23 
 
 		 1255 aa  58.2  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.58 
 
 		 932 aa  58.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  24.12 
 
 		 759 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  24.12 
 
 		 759 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  24.12 
 
 		 759 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  24.32 
 
 		 1196 aa  57.4  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>