273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0455 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1059  helicase  62.69 
 
 		 986 aa  1093    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  100 
 
 		 902 aa  1812    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  63.92 
 
 		 902 aa  1129    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  65.29 
 
 		 901 aa  1138    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  70.77 
 
 		 934 aa  1325    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.88 
 
 		 1048 aa  245  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  34.48 
 
 		 1097 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  29.25 
 
 		 636 aa  201  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  37.41 
 
 		 619 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  36.02 
 
 		 622 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  27.76 
 
 		 635 aa  191  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  35.61 
 
 		 622 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  34.63 
 
 		 486 aa  191  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  39 
 
 		 650 aa  189  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.84 
 
 		 606 aa  187  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  38.33 
 
 		 650 aa  185  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  36.42 
 
 		 754 aa  177  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  33.67 
 
 		 643 aa  177  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  26.99 
 
 		 633 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  36.22 
 
 		 752 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  28.42 
 
 		 611 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  28.85 
 
 		 636 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  27.56 
 
 		 633 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  28.16 
 
 		 632 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  33.56 
 
 		 655 aa  169  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  32.98 
 
 		 466 aa  168  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.54 
 
 		 1111 aa  166  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  31.65 
 
 		 797 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  34.14 
 
 		 651 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  34.91 
 
 		 633 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  34.27 
 
 		 633 aa  157  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  26.64 
 
 		 748 aa  156  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  31.07 
 
 		 609 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  31.33 
 
 		 686 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  30.02 
 
 		 952 aa  153  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  30.94 
 
 		 715 aa  151  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  33.07 
 
 		 479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  31.4 
 
 		 464 aa  147  9e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  30.47 
 
 		 1077 aa  146  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  31.78 
 
 		 1090 aa  146  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  35.02 
 
 		 716 aa  145  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  33.9 
 
 		 388 aa  134  9e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1116 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  33.7 
 
 		 1082 aa  127  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  31.44 
 
 		 629 aa  125  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1118 aa  121  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  32.46 
 
 		 1196 aa  120  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  31.82 
 
 		 1099 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  30.73 
 
 		 1143 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  30.73 
 
 		 1143 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  27.38 
 
 		 1999 aa  117  7.999999999999999e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1126 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  32.36 
 
 		 2245 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  30.73 
 
 		 1143 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1139 aa  111  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  35 
 
 		 941 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  29.5 
 
 		 1250 aa  106  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  33.11 
 
 		 1189 aa  106  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1247 aa  105  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  30.86 
 
 		 1408 aa  105  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1215 aa  104  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  31.03 
 
 		 1270 aa  103  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  30.32 
 
 		 1151 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  29.55 
 
 		 1153 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  33.92 
 
 		 1121 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  28.76 
 
 		 1163 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  34.41 
 
 		 268 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  28.95 
 
 		 1255 aa  101  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1172 aa  100  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1215 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  27.61 
 
 		 1271 aa  99.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  34.02 
 
 		 553 aa  98.6  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  34.02 
 
 		 553 aa  98.6  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1275 aa  97.8  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  31.11 
 
 		 585 aa  97.8  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  30 
 
 		 795 aa  97.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  28.24 
 
 		 1653 aa  97.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.68 
 
 		 769 aa  95.5  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  32.36 
 
 		 1018 aa  94.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  31.4 
 
 		 283 aa  94.7  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  28.82 
 
 		 521 aa  94.7  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  29.8 
 
 		 1228 aa  94  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  30.88 
 
 		 1198 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  29.03 
 
 		 922 aa  93.2  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  23.53 
 
 		 759 aa  92.8  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  26.13 
 
 		 916 aa  92  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.44 
 
 		 1038 aa  91.7  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.75 
 
 		 1324 aa  91.7  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.82 
 
 		 925 aa  91.3  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  25.53 
 
 		 1126 aa  91.3  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  31.39 
 
 		 659 aa  90.9  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  28.83 
 
 		 928 aa  89.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  22.86 
 
 		 759 aa  89.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  24.15 
 
 		 769 aa  89.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  23.43 
 
 		 759 aa  89  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  33.66 
 
 		 237 aa  88.6  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  23.64 
 
 		 759 aa  87.8  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  23.21 
 
 		 759 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.43 
 
 		 759 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.48 
 
 		 1428 aa  87.4  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>