180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2223 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  43.04 
 
 		 1196 aa  779    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  40.54 
 
 		 1153 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  47.8 
 
 		 1324 aa  729    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  71.18 
 
 		 1143 aa  1549    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  46.57 
 
 		 1250 aa  975    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  45.57 
 
 		 1215 aa  872    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  71.18 
 
 		 1143 aa  1549    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  82.52 
 
 		 1151 aa  1905    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  71.09 
 
 		 1143 aa  1543    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  100 
 
 		 1163 aa  2352    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  38.42 
 
 		 1247 aa  679    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  62.63 
 
 		 1139 aa  1405    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  46.89 
 
 		 1228 aa  931    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  41.28 
 
 		 1270 aa  771    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  45.76 
 
 		 1215 aa  884    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  37.29 
 
 		 1198 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  37.18 
 
 		 1082 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1118 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1126 aa  486  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1116 aa  476  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  44.26 
 
 		 1350 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1172 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  37.49 
 
 		 1175 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  41.63 
 
 		 522 aa  351  5e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  39.41 
 
 		 1280 aa  251  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  41.23 
 
 		 1121 aa  245  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.76 
 
 		 934 aa  111  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  29.38 
 
 		 480 aa  107  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.76 
 
 		 902 aa  102  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  26.51 
 
 		 1255 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.72 
 
 		 486 aa  100  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.81 
 
 		 606 aa  99  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  29.44 
 
 		 1271 aa  98.6  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  29.11 
 
 		 986 aa  95.9  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1259 aa  95.5  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  25.59 
 
 		 494 aa  95.1  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1275 aa  94.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  26.56 
 
 		 902 aa  92  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  27.91 
 
 		 487 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  28.19 
 
 		 901 aa  89.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  26.82 
 
 		 1427 aa  85.9  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  30.23 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  30.23 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  26.8 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  26.8 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  24.39 
 
 		 512 aa  82.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.37 
 
 		 752 aa  82  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  24.83 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.94 
 
 		 1038 aa  80.9  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  27.24 
 
 		 486 aa  81.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  28.03 
 
 		 636 aa  81.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  31.54 
 
 		 659 aa  77.4  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  27.21 
 
 		 635 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  28.84 
 
 		 609 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  24.26 
 
 		 1048 aa  76.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  27.16 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.62 
 
 		 932 aa  75.5  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  24.83 
 
 		 1403 aa  75.1  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  28.21 
 
 		 464 aa  74.3  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.95 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  23.2 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  24.31 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  24.7 
 
 		 1408 aa  72.4  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25.09 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  24.93 
 
 		 925 aa  72  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.61 
 
 		 1099 aa  71.6  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  26.32 
 
 		 1077 aa  71.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  50 
 
 		 193 aa  70.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.96 
 
 		 1189 aa  70.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.82 
 
 		 1203 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  23.98 
 
 		 1097 aa  69.7  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.71 
 
 		 1620 aa  70.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  26.54 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  28.88 
 
 		 716 aa  68.9  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.16 
 
 		 585 aa  67.4  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  27.44 
 
 		 535 aa  67.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23.49 
 
 		 797 aa  68.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  22.56 
 
 		 633 aa  67.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  25.95 
 
 		 914 aa  67  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  23.94 
 
 		 629 aa  67.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  23.37 
 
 		 1111 aa  65.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  25.36 
 
 		 1090 aa  65.5  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.84 
 
 		 1585 aa  65.1  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  26.6 
 
 		 2245 aa  65.1  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  24.84 
 
 		 1585 aa  65.1  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  26.39 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  23.87 
 
 		 1653 aa  64.7  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1062 aa  64.3  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  23.53 
 
 		 611 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  25.1 
 
 		 650 aa  64.3  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  22.22 
 
 		 686 aa  63.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  29.82 
 
 		 268 aa  63.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  25.1 
 
 		 650 aa  63.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.71 
 
 		 1999 aa  63.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  25.44 
 
 		 297 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  23.28 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  24.56 
 
 		 396 aa  62  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  22.54 
 
 		 1132 aa  61.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  24.43 
 
 		 922 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  30.59 
 
 		 619 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>