215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1107 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  100 
 
 
1121 aa  2283    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  34.9 
 
 
1118 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  33.57 
 
 
1126 aa  532  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  32.08 
 
 
1116 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  33.36 
 
 
1198 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  27.04 
 
 
1172 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  44.63 
 
 
1153 aa  306  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  43.07 
 
 
1151 aa  264  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  41.23 
 
 
1163 aa  264  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  44.04 
 
 
1139 aa  259  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  41.94 
 
 
1270 aa  254  4.0000000000000004e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  43.18 
 
 
1250 aa  254  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  41.12 
 
 
1228 aa  242  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  40.62 
 
 
1143 aa  240  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  40.62 
 
 
1143 aa  240  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  43.89 
 
 
1175 aa  238  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  44.04 
 
 
1324 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  40.04 
 
 
1143 aa  237  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  32.8 
 
 
1082 aa  234  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  38.37 
 
 
1196 aa  233  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  40.67 
 
 
1247 aa  230  9e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  39.61 
 
 
1215 aa  230  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  47.72 
 
 
1280 aa  229  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  37.53 
 
 
1350 aa  221  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  38.96 
 
 
1215 aa  219  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  28.46 
 
 
522 aa  161  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  31.54 
 
 
934 aa  120  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  33.92 
 
 
902 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  31.15 
 
 
902 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  27.9 
 
 
480 aa  114  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  30.32 
 
 
986 aa  114  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  33.95 
 
 
901 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.07 
 
 
606 aa  108  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.68 
 
 
752 aa  104  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  31 
 
 
1259 aa  101  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  29.06 
 
 
1271 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  25.98 
 
 
1275 aa  94  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  29.79 
 
 
486 aa  91.7  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  25.37 
 
 
1255 aa  89  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  24.76 
 
 
396 aa  88.2  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.73 
 
 
932 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.74 
 
 
922 aa  87  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  27.21 
 
 
609 aa  85.9  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.79 
 
 
629 aa  83.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  21.49 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  23.7 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.74 
 
 
916 aa  81.6  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  24.02 
 
 
512 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  24.23 
 
 
486 aa  79.3  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  24.73 
 
 
797 aa  79  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  20.63 
 
 
512 aa  78.2  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  24.78 
 
 
925 aa  78.2  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.94 
 
 
1097 aa  77.4  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  25.06 
 
 
585 aa  77.4  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.95 
 
 
1048 aa  77.4  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  27.14 
 
 
632 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25.75 
 
 
636 aa  76.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  27.59 
 
 
758 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  24.65 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  23.5 
 
 
493 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  23.5 
 
 
493 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  27.53 
 
 
491 aa  72.8  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  23.76 
 
 
1038 aa  72.4  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.4 
 
 
1090 aa  72  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  23.94 
 
 
633 aa  72  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  25.63 
 
 
914 aa  71.6  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  28.72 
 
 
946 aa  71.6  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  26.91 
 
 
315 aa  70.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3303  hypothetical protein  30.19 
 
 
222 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  27.05 
 
 
611 aa  69.7  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  26.37 
 
 
769 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  23.81 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.62 
 
 
636 aa  68.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.73 
 
 
635 aa  68.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  26.58 
 
 
502 aa  66.6  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  20.95 
 
 
472 aa  67.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  24.89 
 
 
1403 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  26.53 
 
 
914 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.52 
 
 
1077 aa  66.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 
659 aa  66.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  30.16 
 
 
622 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  24.82 
 
 
466 aa  65.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  25.83 
 
 
759 aa  65.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  23.08 
 
 
633 aa  65.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  26.09 
 
 
479 aa  65.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  27.08 
 
 
754 aa  65.1  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.09 
 
 
769 aa  65.1  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  26.91 
 
 
928 aa  64.7  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.72 
 
 
759 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  26.27 
 
 
622 aa  64.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  24.37 
 
 
795 aa  64.3  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  21.9 
 
 
1428 aa  63.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.27 
 
 
759 aa  63.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  28 
 
 
1220 aa  63.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  30.56 
 
 
619 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  28.82 
 
 
1189 aa  63.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  25.46 
 
 
759 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  30.12 
 
 
553 aa  63.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  30.12 
 
 
553 aa  63.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  25.46 
 
 
759 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>