182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  46.61 
 
 		 1215 aa  931    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  49.26 
 
 		 1228 aa  1003    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  48.87 
 
 		 1143 aa  969    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  44.9 
 
 		 1196 aa  838    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  47.26 
 
 		 1215 aa  950    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  48.87 
 
 		 1143 aa  969    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  47.89 
 
 		 1151 aa  990    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  42.18 
 
 		 1153 aa  660    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  48.71 
 
 		 1143 aa  959    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  39.97 
 
 		 1247 aa  759    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  46.86 
 
 		 1163 aa  993    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  47.95 
 
 		 1139 aa  1004    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  46.7 
 
 		 1350 aa  981    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  100 
 
 		 1250 aa  2474    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  49.2 
 
 		 1324 aa  728    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  43.79 
 
 		 1270 aa  824    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  39.41 
 
 		 1198 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  33.07 
 
 		 1118 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  36.7 
 
 		 1175 aa  458  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  31 
 
 		 1116 aa  446  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1126 aa  440  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1172 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  40.79 
 
 		 1280 aa  364  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  39.07 
 
 		 522 aa  339  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  44.95 
 
 		 1082 aa  254  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  38.52 
 
 		 1121 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.64 
 
 		 934 aa  115  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1259 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  28.34 
 
 		 986 aa  110  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.43 
 
 		 606 aa  109  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.53 
 
 		 902 aa  108  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  29.5 
 
 		 902 aa  106  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  30.85 
 
 		 1271 aa  104  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.88 
 
 		 636 aa  95.9  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  24.07 
 
 		 487 aa  94.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.56 
 
 		 1038 aa  94.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  25.52 
 
 		 797 aa  91.3  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  24.12 
 
 		 1048 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  34.24 
 
 		 659 aa  84.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  23.53 
 
 		 636 aa  84.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  23.69 
 
 		 512 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  25.37 
 
 		 486 aa  84  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  22.44 
 
 		 1090 aa  83.2  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  25 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  23.28 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  29.72 
 
 		 651 aa  82  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  24.88 
 
 		 609 aa  82  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  24.38 
 
 		 1077 aa  80.9  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.43 
 
 		 752 aa  80.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  27.05 
 
 		 901 aa  80.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  23.94 
 
 		 686 aa  79  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  23.59 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.94 
 
 		 1097 aa  77.8  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  27.06 
 
 		 1427 aa  76.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  26.21 
 
 		 1255 aa  76.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  25.55 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  27.41 
 
 		 925 aa  75.1  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  24.69 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  25.34 
 
 		 1653 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  28.21 
 
 		 1620 aa  72.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.97 
 
 		 629 aa  72.8  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  28.13 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  24.52 
 
 		 1261 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  25.88 
 
 		 493 aa  72  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  25.88 
 
 		 493 aa  72  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  29.13 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  29.13 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  24.67 
 
 		 454 aa  70.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  26.74 
 
 		 1999 aa  70.5  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.33 
 
 		 635 aa  68.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  24.3 
 
 		 1585 aa  67.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.3 
 
 		 1585 aa  67.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  24.16 
 
 		 495 aa  67.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  31.05 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  31.05 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  24.08 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  24.47 
 
 		 1408 aa  66.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25 
 
 		 932 aa  65.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  22.14 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  50.79 
 
 		 193 aa  65.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  23.73 
 
 		 632 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.17 
 
 		 922 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  25.73 
 
 		 622 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  25.97 
 
 		 619 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  25.22 
 
 		 716 aa  63.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  24.85 
 
 		 1126 aa  62.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  27.33 
 
 		 1403 aa  62  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  24.7 
 
 		 622 aa  62  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  23.88 
 
 		 952 aa  60.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1275 aa  60.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  26.26 
 
 		 946 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  25.72 
 
 		 388 aa  60.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2673  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.7 
 
 		 448 aa  60.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000150277  normal  0.0245588 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  22.18 
 
 		 633 aa  59.3  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  22.22 
 
 		 715 aa  58.9  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  25.93 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  24.15 
 
 		 916 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.74 
 
 		 1203 aa  57.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  25.19 
 
 		 2245 aa  57.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  26.53 
 
 		 1190 aa  57  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>