246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0955 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  100 
 
 
655 aa  1341    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  49.4 
 
 
754 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  45.74 
 
 
643 aa  550  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  45.31 
 
 
650 aa  547  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  45.01 
 
 
650 aa  544  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  41.78 
 
 
633 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  42.37 
 
 
633 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  41.74 
 
 
633 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  40.62 
 
 
633 aa  434  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  33.97 
 
 
622 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  34.47 
 
 
619 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  33.65 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  32.23 
 
 
651 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  31.2 
 
 
636 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  30.25 
 
 
748 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  31.51 
 
 
636 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  31.47 
 
 
609 aa  277  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  33.76 
 
 
611 aa  276  9e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  30.92 
 
 
632 aa  273  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  32.18 
 
 
686 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  29.85 
 
 
635 aa  263  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  30.85 
 
 
716 aa  262  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  35.84 
 
 
466 aa  254  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  32.32 
 
 
797 aa  251  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  31.91 
 
 
1090 aa  238  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  34.22 
 
 
464 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  36.02 
 
 
1077 aa  233  9e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  33.94 
 
 
952 aa  224  3e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  33.78 
 
 
1999 aa  216  8e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  35.93 
 
 
479 aa  190  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  31.01 
 
 
2245 aa  187  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  33.99 
 
 
388 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  35.76 
 
 
934 aa  184  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  34.83 
 
 
986 aa  181  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  33.01 
 
 
902 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  33.12 
 
 
1097 aa  172  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  31.46 
 
 
629 aa  171  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  40 
 
 
268 aa  170  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  33.56 
 
 
902 aa  169  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  33.82 
 
 
901 aa  162  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.79 
 
 
1099 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  30.24 
 
 
1048 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  30.52 
 
 
486 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.91 
 
 
752 aa  152  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  28.94 
 
 
553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  28.94 
 
 
553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  30.16 
 
 
1189 aa  147  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  28.22 
 
 
941 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  36.39 
 
 
315 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  25.88 
 
 
795 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  27.65 
 
 
715 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  34.48 
 
 
237 aa  137  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.83 
 
 
606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  29.09 
 
 
1653 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.4 
 
 
585 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.9 
 
 
759 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  28.22 
 
 
1018 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  26.9 
 
 
769 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  26.69 
 
 
759 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  26.28 
 
 
759 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  26.28 
 
 
759 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  26.08 
 
 
759 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  26.54 
 
 
759 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  25.98 
 
 
769 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  26.95 
 
 
759 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  26.49 
 
 
759 aa  114  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  26.28 
 
 
759 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  28.8 
 
 
297 aa  112  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  29.86 
 
 
1038 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  23.23 
 
 
521 aa  109  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.35 
 
 
2310 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  30.32 
 
 
283 aa  107  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  27.51 
 
 
1585 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  27.51 
 
 
1585 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  23.66 
 
 
1427 aa  97.4  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  23.39 
 
 
944 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  27.08 
 
 
1620 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  26.71 
 
 
1284 aa  92.8  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.06 
 
 
1428 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.4 
 
 
1126 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  23.08 
 
 
908 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  37.04 
 
 
219 aa  82  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  27.3 
 
 
1651 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  25.85 
 
 
1271 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  31.43 
 
 
1190 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  28.07 
 
 
1408 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.21 
 
 
254 aa  79.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  25.3 
 
 
1108 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  24.85 
 
 
1126 aa  79  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.91 
 
 
1116 aa  78.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  27.27 
 
 
1041 aa  77  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  22.1 
 
 
1175 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  27.06 
 
 
925 aa  75.5  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  25.57 
 
 
1111 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  25.49 
 
 
1474 aa  72.4  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  26.09 
 
 
922 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.04 
 
 
916 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  38.71 
 
 
1284 aa  71.2  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.75 
 
 
932 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  25.5 
 
 
1118 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>