122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2931 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  100 
 
 		 254 aa  528  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  35.53 
 
 		 1099 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  30.04 
 
 		 1653 aa  88.6  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  33.49 
 
 		 619 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  31.07 
 
 		 797 aa  85.9  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  33.49 
 
 		 622 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  33.33 
 
 		 651 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  33.01 
 
 		 622 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  30.45 
 
 		 1284 aa  81.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  32.03 
 
 		 1585 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  32.03 
 
 		 1585 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  30.21 
 
 		 655 aa  79.3  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  29.02 
 
 		 1077 aa  79  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  29.34 
 
 		 716 aa  77.8  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  28.76 
 
 		 479 aa  75.5  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 		 2310 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  35.32 
 
 		 795 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  28.97 
 
 		 754 aa  72  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  30.61 
 
 		 553 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  33.51 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  30.61 
 
 		 553 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  27.01 
 
 		 633 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  32.06 
 
 		 1212 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  27.53 
 
 		 1111 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  31.47 
 
 		 1190 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  28.22 
 
 		 941 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  29.7 
 
 		 633 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  31.12 
 
 		 1999 aa  68.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1018 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  29.21 
 
 		 633 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  29.17 
 
 		 632 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  28.91 
 
 		 686 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  29.7 
 
 		 633 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  29.32 
 
 		 636 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  30.09 
 
 		 635 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  30 
 
 		 1651 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  26.67 
 
 		 952 aa  65.5  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  26.03 
 
 		 715 aa  65.1  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  27.8 
 
 		 1090 aa  64.7  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  30.89 
 
 		 2245 aa  64.7  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  27.31 
 
 		 521 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  33.01 
 
 		 1175 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.56 
 
 		 1189 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  29.86 
 
 		 748 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  30.39 
 
 		 611 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  26.38 
 
 		 636 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  31.66 
 
 		 1126 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  28.71 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.88 
 
 		 752 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.56 
 
 		 934 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  31.65 
 
 		 629 aa  60.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  28.04 
 
 		 609 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  27.35 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  27.97 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  29.41 
 
 		 1620 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  31.16 
 
 		 902 aa  59.7  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  31.49 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  26.84 
 
 		 1284 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1126 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.73 
 
 		 946 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  36.9 
 
 		 585 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  30.98 
 
 		 1082 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  28.83 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  33.33 
 
 		 944 aa  55.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  27.68 
 
 		 1108 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.32 
 
 		 1324 aa  55.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1116 aa  55.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  37.78 
 
 		 1198 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  30 
 
 		 606 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  27.14 
 
 		 902 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  36.05 
 
 		 1143 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  26.98 
 
 		 464 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.35 
 
 		 1038 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  25.1 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.36 
 
 		 986 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  28.07 
 
 		 1132 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  26.6 
 
 		 643 aa  53.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  36.05 
 
 		 1143 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  36.05 
 
 		 1143 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  28.25 
 
 		 1151 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  26.43 
 
 		 388 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.79 
 
 		 1428 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 		 1041 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  32.73 
 
 		 1280 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  29.41 
 
 		 1137 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  25 
 
 		 901 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  25.76 
 
 		 297 aa  49.3  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1092 aa  49.7  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  34.68 
 
 		 1422 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  25.84 
 
 		 1427 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1118 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1172 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  34.04 
 
 		 958 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  34.88 
 
 		 1153 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  27.69 
 
 		 1171 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  36.05 
 
 		 1163 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1247 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  27.74 
 
 		 925 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  24.15 
 
 		 1048 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1176 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>