91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_259 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  40.97 
 
 		 1422 aa  705    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  42.67 
 
 		 1427 aa  741    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  100 
 
 		 944 aa  1956    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  29.76 
 
 		 1077 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  29.55 
 
 		 1090 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  28.87 
 
 		 795 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  27.76 
 
 		 797 aa  104  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  24.57 
 
 		 1999 aa  100  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.25 
 
 		 754 aa  99  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  29.91 
 
 		 622 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.38 
 
 		 622 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  29.28 
 
 		 619 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  23.39 
 
 		 655 aa  93.2  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.12 
 
 		 1099 aa  91.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  30.36 
 
 		 479 aa  91.3  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  28.48 
 
 		 1189 aa  91.3  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 		 2310 aa  89.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  28.19 
 
 		 2245 aa  88.6  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  28.01 
 
 		 466 aa  87.4  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  26.33 
 
 		 633 aa  87  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  27.87 
 
 		 651 aa  86.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  27.96 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  26.33 
 
 		 633 aa  84.3  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27.22 
 
 		 633 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  25.55 
 
 		 553 aa  82.4  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  25.55 
 
 		 553 aa  82.4  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  28.18 
 
 		 611 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  28.24 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  23.24 
 
 		 633 aa  77  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  26.56 
 
 		 748 aa  77.4  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  23.55 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.85 
 
 		 632 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  23.74 
 
 		 650 aa  77  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  26.99 
 
 		 952 aa  74.7  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  23.29 
 
 		 1620 aa  74.3  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  23.57 
 
 		 716 aa  74.3  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.92 
 
 		 635 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  25 
 
 		 1018 aa  72.8  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.64 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  27.16 
 
 		 1653 aa  71.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  28.95 
 
 		 901 aa  71.2  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  26.6 
 
 		 636 aa  71.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  27.53 
 
 		 521 aa  70.5  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  22.85 
 
 		 715 aa  70.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  26.18 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  27 
 
 		 934 aa  68.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  28.25 
 
 		 941 aa  67.8  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  26.45 
 
 		 1097 aa  67.4  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.47 
 
 		 902 aa  66.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  26.76 
 
 		 609 aa  65.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  26.76 
 
 		 686 aa  65.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  24.68 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  24.19 
 
 		 1108 aa  64.7  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.91 
 
 		 752 aa  63.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.82 
 
 		 629 aa  62.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.5 
 
 		 585 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  23.68 
 
 		 986 aa  61.2  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  26.06 
 
 		 268 aa  60.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  23.48 
 
 		 1284 aa  60.1  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  22.85 
 
 		 1048 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  25.59 
 
 		 1111 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  24.25 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  24 
 
 		 902 aa  57  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  25.13 
 
 		 1284 aa  56.2  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.33 
 
 		 254 aa  55.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  26.5 
 
 		 1651 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  27.16 
 
 		 659 aa  55.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  33.33 
 
 		 237 aa  54.7  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  27.87 
 
 		 946 aa  54.3  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.81 
 
 		 606 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  22.03 
 
 		 1585 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  27.62 
 
 		 1270 aa  53.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  22.03 
 
 		 1585 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49919  predicted protein  29.46 
 
 		 1040 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.099413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  22.92 
 
 		 1190 aa  52  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  32.18 
 
 		 758 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  34.72 
 
 		 925 aa  51.2  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  22.92 
 
 		 1408 aa  51.6  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68531  predicted protein  25.61 
 
 		 1114 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.134601  normal  0.0417383 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  24.32 
 
 		 1041 aa  49.3  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.05 
 
 		 1250 aa  49.7  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  31.79 
 
 		 1082 aa  48.9  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.44 
 
 		 1038 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  27.36 
 
 		 1175 aa  48.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.85 
 
 		 732 aa  47.8  0.0009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  29.17 
 
 		 914 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  24.83 
 
 		 1280 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  27.48 
 
 		 283 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  21.82 
 
 		 1196 aa  45.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  27.78 
 
 		 904 aa  44.7  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  35.16 
 
 		 1143 aa  44.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>