82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49919 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_49919  predicted protein  100 
 
 		 1040 aa  2155    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.099413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.26 
 
 		 1099 aa  73.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1018 aa  67  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.69 
 
 		 629 aa  63.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23853  predicted protein  38.71 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.74 
 
 		 752 aa  60.1  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  26.05 
 
 		 902 aa  58.9  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  24.45 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  26.57 
 
 		 1980 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  22.41 
 
 		 834 aa  57  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  40.51 
 
 		 585 aa  56.2  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  23.78 
 
 		 1151 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.9 
 
 		 1999 aa  55.1  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.95 
 
 		 1196 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  35.14 
 
 		 754 aa  53.9  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  23.48 
 
 		 934 aa  54.3  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  25.18 
 
 		 611 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 1620 aa  52.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  29.56 
 
 		 553 aa  53.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  29.56 
 
 		 553 aa  53.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  27.33 
 
 		 632 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  35.29 
 
 		 1280 aa  52.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  29.46 
 
 		 944 aa  52  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.6 
 
 		 1585 aa  51.6  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  20.79 
 
 		 806 aa  51.6  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.6 
 
 		 1585 aa  51.6  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  26.05 
 
 		 651 aa  51.6  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  25.44 
 
 		 1983 aa  51.6  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.72 
 
 		 636 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  31.54 
 
 		 1077 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1118 aa  50.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  23.57 
 
 		 1163 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  38.04 
 
 		 795 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1247 aa  50.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  25.38 
 
 		 622 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  29.03 
 
 		 716 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  26.45 
 
 		 1489 aa  49.3  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  35.16 
 
 		 1153 aa  49.3  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1126 aa  49.3  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  40.54 
 
 		 1143 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  24.07 
 
 		 1408 aa  48.9  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  24.63 
 
 		 1589 aa  48.9  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  40.54 
 
 		 1143 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1121 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  40.54 
 
 		 1143 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  24.91 
 
 		 941 aa  48.5  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  24.73 
 
 		 1270 aa  48.5  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.63 
 
 		 1324 aa  48.1  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  23.64 
 
 		 1041 aa  48.1  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  31.25 
 
 		 655 aa  48.1  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  25.29 
 
 		 619 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  22.83 
 
 		 1250 aa  47.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  31.4 
 
 		 643 aa  47.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  22.04 
 
 		 833 aa  47.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1116 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  24.21 
 
 		 1048 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  25.78 
 
 		 792 aa  47  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  26.61 
 
 		 635 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  25.38 
 
 		 622 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  37.8 
 
 		 633 aa  46.6  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  26.14 
 
 		 958 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  29.69 
 
 		 633 aa  47  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  36.9 
 
 		 1189 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.8 
 
 		 606 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1822 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.11 
 
 		 1428 aa  46.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  24.81 
 
 		 1991 aa  46.2  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  23.08 
 
 		 986 aa  46.2  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1172 aa  46.2  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1589 aa  45.8  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  27 
 
 		 2245 aa  45.8  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  28 
 
 		 1427 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  25.61 
 
 		 1653 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  29.73 
 
 		 464 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  23.08 
 
 		 902 aa  45.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1589 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  24 
 
 		 1328 aa  45.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  31.3 
 
 		 797 aa  45.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  27.8 
 
 		 1190 aa  45.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  25.09 
 
 		 1296 aa  45.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  33.33 
 
 		 636 aa  45.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  32.93 
 
 		 633 aa  44.7  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>