252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0828 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  70.25 
 
 
633 aa  924    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  94.47 
 
 
633 aa  1215    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  100 
 
 
633 aa  1278    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  93.21 
 
 
633 aa  1203    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  44.1 
 
 
650 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  44.1 
 
 
650 aa  503  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  44.79 
 
 
643 aa  485  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  41.78 
 
 
655 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  40.33 
 
 
754 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  33.87 
 
 
611 aa  268  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  32.53 
 
 
632 aa  268  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  31.56 
 
 
635 aa  267  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  32.37 
 
 
609 aa  267  5e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  30.49 
 
 
636 aa  264  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  31.05 
 
 
636 aa  258  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  33.59 
 
 
686 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  30.28 
 
 
622 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  30.15 
 
 
622 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  34.48 
 
 
716 aa  241  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  30.84 
 
 
748 aa  239  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  30.3 
 
 
651 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  29.84 
 
 
466 aa  204  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  28.67 
 
 
1090 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  30.88 
 
 
952 aa  187  6e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  31.4 
 
 
464 aa  186  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  28.41 
 
 
797 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  34.43 
 
 
619 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  34.55 
 
 
902 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  35.88 
 
 
479 aa  172  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  34.06 
 
 
986 aa  171  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  26.39 
 
 
1077 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  29.01 
 
 
1099 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  27 
 
 
1999 aa  167  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  34.11 
 
 
934 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  27.99 
 
 
2245 aa  162  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  34.27 
 
 
902 aa  157  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  30.82 
 
 
629 aa  154  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  28.66 
 
 
715 aa  151  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.55 
 
 
585 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  35.74 
 
 
901 aa  148  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  27.57 
 
 
553 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  27.57 
 
 
553 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  33.33 
 
 
388 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  36.23 
 
 
268 aa  141  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  36.5 
 
 
752 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  31.33 
 
 
1048 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  28.4 
 
 
941 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  25.38 
 
 
795 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  31.35 
 
 
1097 aa  130  7.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  33.8 
 
 
315 aa  126  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.84 
 
 
1189 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  27.56 
 
 
1038 aa  121  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  27.09 
 
 
1018 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.65 
 
 
486 aa  114  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.05 
 
 
606 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  29.04 
 
 
1653 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  25.47 
 
 
521 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  34.59 
 
 
237 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  24.4 
 
 
759 aa  105  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  24.4 
 
 
759 aa  104  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  24.47 
 
 
769 aa  104  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  24.6 
 
 
759 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  24.4 
 
 
759 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  23.69 
 
 
759 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  23.69 
 
 
759 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.4 
 
 
759 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  24.01 
 
 
759 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  24.4 
 
 
759 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.62 
 
 
769 aa  100  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  29.38 
 
 
1284 aa  99  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  26.06 
 
 
1427 aa  99.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  27.44 
 
 
1585 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  27.44 
 
 
1585 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24.82 
 
 
1002 aa  96.3  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  25.93 
 
 
1175 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  28.81 
 
 
1111 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  27.34 
 
 
922 aa  90.5  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  22.68 
 
 
1428 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.82 
 
 
1620 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  23.22 
 
 
1408 aa  88.6  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.52 
 
 
932 aa  87.4  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  29.55 
 
 
283 aa  87  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  27.21 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  22.45 
 
 
1422 aa  84.7  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  25.61 
 
 
1108 aa  84.7  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  29.08 
 
 
2098 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  29.08 
 
 
2098 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.95 
 
 
925 aa  83.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  27.47 
 
 
1270 aa  83.2  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  22.66 
 
 
1190 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  27.22 
 
 
944 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  25.1 
 
 
1427 aa  80.1  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.63 
 
 
916 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  25.96 
 
 
1082 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  22.01 
 
 
659 aa  78.2  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  21.57 
 
 
906 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
2101 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
2101 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.53 
 
 
1116 aa  77.4  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
2098 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>