143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0935 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  100 
 
 		 1172 aa  2440    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  37.48 
 
 		 1116 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  37.77 
 
 		 1126 aa  670    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1118 aa  680    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  32.57 
 
 		 1082 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  30.49 
 
 		 1163 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  30.86 
 
 		 1151 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1139 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  30.34 
 
 		 1198 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  31.2 
 
 		 1153 aa  449  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  30.97 
 
 		 1143 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  30.97 
 
 		 1143 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  30.83 
 
 		 1143 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1215 aa  432  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  28.75 
 
 		 1196 aa  422  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1215 aa  422  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  29.88 
 
 		 1250 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1121 aa  351  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1175 aa  338  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  36.4 
 
 		 1228 aa  260  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  35.85 
 
 		 1247 aa  246  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  35.37 
 
 		 1270 aa  246  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.57 
 
 		 1324 aa  235  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1350 aa  206  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  39.03 
 
 		 1280 aa  204  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  29.78 
 
 		 522 aa  163  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  71.26 
 
 		 193 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.43 
 
 		 606 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  26.46 
 
 		 480 aa  110  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  25.07 
 
 		 934 aa  107  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  23.26 
 
 		 902 aa  107  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1259 aa  105  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  23.66 
 
 		 494 aa  103  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  23.37 
 
 		 487 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  22.37 
 
 		 902 aa  100  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  26.26 
 
 		 512 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.06 
 
 		 752 aa  97.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  26.17 
 
 		 493 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  26.17 
 
 		 493 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  26.7 
 
 		 1090 aa  96.7  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  23.28 
 
 		 986 aa  95.5  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  24.77 
 
 		 512 aa  95.1  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.48 
 
 		 1097 aa  92.8  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  27.45 
 
 		 635 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.89 
 
 		 632 aa  90.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  23.09 
 
 		 486 aa  89.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.37 
 
 		 1048 aa  86.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.91 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  25.06 
 
 		 797 aa  85.9  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  26.01 
 
 		 636 aa  85.5  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  25.3 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  21.87 
 
 		 901 aa  84.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  24.81 
 
 		 1271 aa  84  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.75 
 
 		 1077 aa  84  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  26.47 
 
 		 521 aa  83.2  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  26.41 
 
 		 609 aa  81.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  24.92 
 
 		 636 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1275 aa  80.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  23.5 
 
 		 1255 aa  77.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.2 
 
 		 1038 aa  75.5  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  27.4 
 
 		 619 aa  75.1  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  24.22 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.69 
 
 		 1099 aa  74.3  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  22.62 
 
 		 650 aa  73.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.05 
 
 		 622 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  23.28 
 
 		 1408 aa  73.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  26.69 
 
 		 622 aa  72.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  22.62 
 
 		 650 aa  72  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.62 
 
 		 629 aa  71.6  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  27.36 
 
 		 716 aa  72  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  23.5 
 
 		 585 aa  70.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  23.78 
 
 		 633 aa  69.7  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  24.6 
 
 		 928 aa  68.6  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  24.24 
 
 		 643 aa  68.2  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25.08 
 
 		 655 aa  67.8  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  24.84 
 
 		 1653 aa  66.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  27.76 
 
 		 925 aa  65.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  29.27 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1018 aa  65.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  30.1 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  24.91 
 
 		 297 aa  64.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  22.86 
 
 		 1427 aa  63.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  24.32 
 
 		 633 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  22.32 
 
 		 1457 aa  63.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  23.32 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.95 
 
 		 932 aa  62.4  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3303  hypothetical protein  29.1 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  26.51 
 
 		 758 aa  62  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  25.08 
 
 		 1126 aa  62  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  24.85 
 
 		 1620 aa  61.6  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  22.04 
 
 		 686 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  22.58 
 
 		 1585 aa  60.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  25.36 
 
 		 651 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  23.4 
 
 		 633 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  22.58 
 
 		 1585 aa  60.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  23.84 
 
 		 1999 aa  59.3  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  24.75 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  24.75 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  21.25 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  21.43 
 
 		 795 aa  58.9  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>