179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4582 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  46.74 
 
 		 1363 aa  1157    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  34.75 
 
 		 1296 aa  749    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  100 
 
 		 1328 aa  2739    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.57 
 
 		 1403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  30.93 
 
 		 2013 aa  226  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  31.31 
 
 		 1973 aa  220  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  33.48 
 
 		 2016 aa  218  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  35.06 
 
 		 2222 aa  216  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  33.26 
 
 		 1958 aa  215  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  31.84 
 
 		 1958 aa  212  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  39.48 
 
 		 2005 aa  211  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  30.19 
 
 		 2198 aa  211  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  31.63 
 
 		 1950 aa  210  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  39.19 
 
 		 1867 aa  208  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  37.72 
 
 		 1622 aa  206  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1823 aa  203  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  31.84 
 
 		 2098 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  31.7 
 
 		 2098 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  31.91 
 
 		 2204 aa  202  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  33.26 
 
 		 1803 aa  201  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  35.88 
 
 		 2125 aa  201  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  35.88 
 
 		 2125 aa  201  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  29.75 
 
 		 2207 aa  201  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  31.54 
 
 		 2759 aa  201  9e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  30.74 
 
 		 1945 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  31.91 
 
 		 2197 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  36.44 
 
 		 1822 aa  197  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  31.71 
 
 		 1959 aa  197  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  29.33 
 
 		 1559 aa  196  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  30.92 
 
 		 1754 aa  194  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  29.07 
 
 		 1822 aa  193  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  29.75 
 
 		 1980 aa  193  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  28.62 
 
 		 2045 aa  191  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  33.1 
 
 		 1838 aa  191  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  34.63 
 
 		 1888 aa  190  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  31 
 
 		 1722 aa  190  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 		 2104 aa  189  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  30.89 
 
 		 1986 aa  188  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  31.13 
 
 		 1983 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  31.47 
 
 		 2002 aa  186  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  34.81 
 
 		 1367 aa  185  6e-45  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  33.05 
 
 		 2123 aa  184  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1328 aa  184  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 2101 aa  183  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 2101 aa  183  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1801 aa  183  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 2098 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  33.13 
 
 		 1285 aa  180  1e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1572 aa  180  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1904 aa  179  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1854 aa  178  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  28.33 
 
 		 1991 aa  176  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33.85 
 
 		 1312 aa  174  9e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1575 aa  174  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  34.02 
 
 		 1593 aa  172  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  31.22 
 
 		 1559 aa  170  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1589 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1589 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  29.6 
 
 		 1877 aa  169  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  36.42 
 
 		 1589 aa  168  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  31.99 
 
 		 1861 aa  165  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  33.42 
 
 		 2096 aa  164  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  27.84 
 
 		 1571 aa  157  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  29.68 
 
 		 1853 aa  156  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  29.87 
 
 		 1050 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1400 aa  111  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  28.42 
 
 		 1557 aa  104  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1652 aa  102  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  28.27 
 
 		 1629 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1407 aa  100  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  27.04 
 
 		 1630 aa  98.6  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  32.8 
 
 		 903 aa  96.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  28.03 
 
 		 906 aa  95.5  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  28.04 
 
 		 1121 aa  95.5  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  27.67 
 
 		 1622 aa  93.6  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  29.19 
 
 		 1790 aa  92.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  27.49 
 
 		 1649 aa  92  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  27.34 
 
 		 905 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  25.56 
 
 		 900 aa  90.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  24.83 
 
 		 1489 aa  90.1  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  27.34 
 
 		 905 aa  90.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  26.7 
 
 		 907 aa  89.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  27.3 
 
 		 946 aa  89.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25.52 
 
 		 905 aa  88.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  27.78 
 
 		 1490 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  25.41 
 
 		 905 aa  87  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  25.48 
 
 		 905 aa  87  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1506 aa  86.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  28.39 
 
 		 1697 aa  84  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  27 
 
 		 1474 aa  84  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.15 
 
 		 629 aa  83.2  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  26.44 
 
 		 908 aa  82.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1413 aa  81.6  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  23.22 
 
 		 1412 aa  81.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1499 aa  80.1  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  26 
 
 		 1410 aa  80.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1392 aa  77.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 1203 aa  77  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.21 
 
 		 1196 aa  75.5  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  27.09 
 
 		 1575 aa  74.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>