120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3926 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1190 aa  2404    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  34.93 
 
 		 1175 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  30.34 
 
 		 1212 aa  462  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  29.33 
 
 		 1137 aa  343  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  26.53 
 
 		 754 aa  114  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.8 
 
 		 585 aa  112  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  24.03 
 
 		 650 aa  110  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  24.68 
 
 		 650 aa  109  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  28.6 
 
 		 464 aa  106  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  27.65 
 
 		 479 aa  104  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.45 
 
 		 622 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  27.91 
 
 		 619 aa  99.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  24.71 
 
 		 797 aa  99  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.27 
 
 		 1099 aa  98.6  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  22.83 
 
 		 1999 aa  97.8  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  27.45 
 
 		 622 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  27.27 
 
 		 1585 aa  95.5  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  27.27 
 
 		 1585 aa  95.5  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.29 
 
 		 1090 aa  95.5  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  26.36 
 
 		 1284 aa  91.7  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  24.33 
 
 		 1077 aa  90.9  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  30.9 
 
 		 1189 aa  89.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1018 aa  87.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  24.5 
 
 		 1620 aa  86.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  26.76 
 
 		 941 aa  85.9  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  22.4 
 
 		 633 aa  85.5  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  22.3 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  25.51 
 
 		 553 aa  84  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  25.51 
 
 		 553 aa  84  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  22.66 
 
 		 633 aa  82.8  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.23 
 
 		 609 aa  82  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  29.67 
 
 		 2245 aa  81.3  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  28.61 
 
 		 651 aa  81.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  25.51 
 
 		 934 aa  80.9  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  31.43 
 
 		 655 aa  80.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  35.94 
 
 		 716 aa  79.7  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  24.73 
 
 		 643 aa  79  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  29.59 
 
 		 611 aa  78.2  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  24.07 
 
 		 986 aa  77.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  24.93 
 
 		 1653 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  24.35 
 
 		 636 aa  77.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  24.09 
 
 		 748 aa  75.1  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  26.47 
 
 		 486 aa  73.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  25.64 
 
 		 902 aa  72.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  27.35 
 
 		 902 aa  72  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  28.43 
 
 		 632 aa  71.6  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  30.73 
 
 		 466 aa  71.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  25.57 
 
 		 1126 aa  71.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  24.05 
 
 		 952 aa  70.1  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.75 
 
 		 752 aa  70.1  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  26.65 
 
 		 388 aa  70.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.47 
 
 		 254 aa  70.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.02 
 
 		 1038 aa  70.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  28.02 
 
 		 635 aa  69.3  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  30 
 
 		 1651 aa  67  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  26.14 
 
 		 1284 aa  66.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  24.18 
 
 		 686 aa  65.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  27.62 
 
 		 633 aa  65.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  28 
 
 		 1082 aa  65.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  29.13 
 
 		 636 aa  65.1  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  27.78 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1139 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  24.39 
 
 		 901 aa  64.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.56 
 
 		 629 aa  63.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  26.26 
 
 		 1108 aa  63.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  27.54 
 
 		 237 aa  61.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  27.91 
 
 		 1427 aa  60.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  33.64 
 
 		 1196 aa  60.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  28.86 
 
 		 1143 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  28.86 
 
 		 1143 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1118 aa  58.9  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  25.59 
 
 		 1228 aa  58.9  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  23.62 
 
 		 715 aa  58.5  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.52 
 
 		 606 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  27.13 
 
 		 283 aa  57.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  28.71 
 
 		 268 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1215 aa  57.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1172 aa  57  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  27.86 
 
 		 1143 aa  57.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  26.53 
 
 		 1250 aa  56.6  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  29.6 
 
 		 1198 aa  57.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.93 
 
 		 1111 aa  57.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  28.77 
 
 		 1422 aa  55.8  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  38.95 
 
 		 1350 aa  55.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  39.09 
 
 		 1280 aa  55.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  28.23 
 
 		 795 aa  55.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  25.19 
 
 		 1185 aa  55.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.06 
 
 		 1428 aa  55.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.3 
 
 		 1324 aa  55.5  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  32.71 
 
 		 1215 aa  52.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1116 aa  52.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  37.76 
 
 		 1408 aa  52.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  22.92 
 
 		 944 aa  52  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  26.96 
 
 		 521 aa  52  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.48 
 
 		 1151 aa  51.6  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 		 2310 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25 
 
 		 1126 aa  50.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.56 
 
 		 1196 aa  50.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1247 aa  50.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  22.81 
 
 		 1048 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>