245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0918 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  58.81 
 
 
643 aa  717    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  100 
 
 
650 aa  1299    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  98.92 
 
 
650 aa  1286    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  45.01 
 
 
655 aa  544  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  47.36 
 
 
754 aa  538  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  44.1 
 
 
633 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  43.48 
 
 
633 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  43.08 
 
 
633 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  41.55 
 
 
633 aa  457  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  35.53 
 
 
622 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  34.34 
 
 
619 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  35.28 
 
 
622 aa  312  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  36.14 
 
 
609 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  33.38 
 
 
651 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  32.4 
 
 
636 aa  279  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  33.83 
 
 
632 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  30.83 
 
 
635 aa  277  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  34.41 
 
 
716 aa  273  6e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  31.37 
 
 
636 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  31.85 
 
 
748 aa  266  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  32.16 
 
 
611 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  36.33 
 
 
686 aa  253  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  34.62 
 
 
466 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  33.95 
 
 
464 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  34.93 
 
 
952 aa  213  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  33.27 
 
 
1999 aa  211  5e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  31.2 
 
 
797 aa  194  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  40 
 
 
934 aa  193  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  40.13 
 
 
388 aa  190  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  33 
 
 
1077 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  32.53 
 
 
1090 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  38.33 
 
 
902 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  37.11 
 
 
479 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  37.14 
 
 
901 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  35.84 
 
 
986 aa  177  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  36.52 
 
 
902 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  30 
 
 
2245 aa  174  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  36.81 
 
 
1097 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.87 
 
 
629 aa  169  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  31.05 
 
 
1048 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  29.15 
 
 
1099 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  31.03 
 
 
553 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  31.03 
 
 
553 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  37.98 
 
 
268 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.5 
 
 
752 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  31.62 
 
 
941 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  33.1 
 
 
606 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  32.14 
 
 
486 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  28.74 
 
 
585 aa  140  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  39.35 
 
 
237 aa  140  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  27.16 
 
 
795 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  28.16 
 
 
715 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  30.61 
 
 
1018 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  31.63 
 
 
1189 aa  128  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  23.75 
 
 
1585 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  23.75 
 
 
1585 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  33.2 
 
 
283 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  29.3 
 
 
1653 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  31.58 
 
 
315 aa  117  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  23.99 
 
 
1620 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  25.06 
 
 
1108 aa  112  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  24.03 
 
 
1190 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  29.41 
 
 
521 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  28.66 
 
 
297 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  29.87 
 
 
1284 aa  103  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  26.95 
 
 
759 aa  99.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  26.74 
 
 
759 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  26.95 
 
 
759 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  29.71 
 
 
1038 aa  98.6  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  26.68 
 
 
759 aa  98.6  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  26.68 
 
 
759 aa  98.6  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  26.95 
 
 
769 aa  98.6  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 
2310 aa  98.2  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  26.74 
 
 
759 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  26.74 
 
 
759 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.53 
 
 
759 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  26.26 
 
 
769 aa  95.9  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.35 
 
 
1428 aa  95.1  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  26.32 
 
 
759 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  26.19 
 
 
1111 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.21 
 
 
1116 aa  92.8  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.84 
 
 
1126 aa  92.8  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  24.63 
 
 
1126 aa  91.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.74 
 
 
1082 aa  87.4  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  27.37 
 
 
928 aa  87.4  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  25.27 
 
 
1284 aa  87.4  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  23.5 
 
 
1175 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.27 
 
 
916 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.24 
 
 
932 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  26.81 
 
 
1041 aa  85.9  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  26.22 
 
 
922 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.43 
 
 
1196 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  22.79 
 
 
1427 aa  85.5  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  29.36 
 
 
1275 aa  84.3  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  27.44 
 
 
659 aa  82.8  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  26.9 
 
 
1651 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  28.98 
 
 
1271 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  24.08 
 
 
1261 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  29.17 
 
 
1270 aa  80.9  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  29.78 
 
 
1408 aa  80.5  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>