231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_41525 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  100 
 
 
466 aa  944    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  40.88 
 
 
479 aa  295  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  38.49 
 
 
754 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  37.8 
 
 
1090 aa  267  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  37.83 
 
 
797 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  37.8 
 
 
1077 aa  265  8.999999999999999e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  37.89 
 
 
952 aa  262  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  39.19 
 
 
622 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  39.49 
 
 
619 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  39.11 
 
 
622 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  35.84 
 
 
655 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  39.63 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  34.62 
 
 
650 aa  229  8e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  34.42 
 
 
650 aa  226  9e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  37.39 
 
 
651 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  32.98 
 
 
609 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  31.03 
 
 
633 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  32.91 
 
 
636 aa  213  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  29.57 
 
 
1999 aa  211  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  30.24 
 
 
633 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  31.44 
 
 
643 aa  206  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  30.36 
 
 
633 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  32.98 
 
 
636 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  46.04 
 
 
268 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  31.26 
 
 
632 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  30.35 
 
 
635 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  30.04 
 
 
633 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  30.73 
 
 
748 aa  196  9e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  29.61 
 
 
611 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  31.78 
 
 
716 aa  189  8e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  32.09 
 
 
2245 aa  188  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  32.58 
 
 
464 aa  188  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  32.98 
 
 
902 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  36.15 
 
 
1189 aa  167  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  33.18 
 
 
934 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  32.9 
 
 
686 aa  163  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  29.1 
 
 
1048 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  29.36 
 
 
715 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  31.73 
 
 
901 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  37.24 
 
 
553 aa  150  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  37.24 
 
 
553 aa  150  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  31.57 
 
 
986 aa  149  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.05 
 
 
752 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.18 
 
 
629 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.41 
 
 
1099 aa  141  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  32.08 
 
 
795 aa  140  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  29.87 
 
 
902 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  28.99 
 
 
1097 aa  136  9e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  32.99 
 
 
315 aa  131  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.52 
 
 
606 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  33.23 
 
 
941 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  27.29 
 
 
585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  30.5 
 
 
1018 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  28.37 
 
 
1038 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  26.57 
 
 
486 aa  113  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  27.94 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  25.83 
 
 
769 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
2310 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  25.62 
 
 
759 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.67 
 
 
759 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  25.47 
 
 
759 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  28.53 
 
 
1653 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  26.49 
 
 
521 aa  106  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.05 
 
 
759 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  25.47 
 
 
759 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  24.48 
 
 
759 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  24.48 
 
 
759 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  24.84 
 
 
759 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  34.93 
 
 
237 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  25.26 
 
 
759 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.21 
 
 
769 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  26.73 
 
 
922 aa  96.3  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  28.21 
 
 
1585 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  28.21 
 
 
1585 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  28.9 
 
 
1457 aa  93.6  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  31.8 
 
 
283 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  26.25 
 
 
916 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  31.99 
 
 
1108 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  28.92 
 
 
1212 aa  90.9  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.89 
 
 
1428 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  25.07 
 
 
1284 aa  88.6  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.37 
 
 
1620 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  28.01 
 
 
944 aa  87.4  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  29.53 
 
 
1041 aa  87  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.16 
 
 
932 aa  86.7  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  44.17 
 
 
219 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  25 
 
 
1427 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 
1651 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  24.8 
 
 
1403 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  27.51 
 
 
1284 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  26.07 
 
 
1589 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  28.08 
 
 
1270 aa  77.4  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  26.07 
 
 
1589 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  24.27 
 
 
1408 aa  77  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  25.7 
 
 
1422 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  24.9 
 
 
1137 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  24.82 
 
 
1958 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  25.9 
 
 
1589 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  26.16 
 
 
1973 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  29.15 
 
 
1175 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>