145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0570 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  43.26 
 
 		 1427 aa  1058    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1457 aa  2974    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  36.11 
 
 		 1403 aa  827    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  28.67 
 
 		 1261 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  31.33 
 
 		 1271 aa  172  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1275 aa  166  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1259 aa  163  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  28.25 
 
 		 1408 aa  155  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  28.16 
 
 		 1255 aa  154  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.09 
 
 		 1428 aa  141  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  29.39 
 
 		 606 aa  108  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  28.9 
 
 		 466 aa  93.2  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  24.11 
 
 		 633 aa  90.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  27.74 
 
 		 643 aa  82.4  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25 
 
 		 1126 aa  82  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.69 
 
 		 1038 aa  81.6  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.73 
 
 		 629 aa  81.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  27.77 
 
 		 902 aa  80.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  23.73 
 
 		 611 aa  80.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1118 aa  80.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.58 
 
 		 754 aa  80.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  24.74 
 
 		 636 aa  80.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  25.24 
 
 		 748 aa  79.3  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1116 aa  78.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  23.97 
 
 		 633 aa  77.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  26.26 
 
 		 934 aa  75.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  25.44 
 
 		 902 aa  73.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  25.25 
 
 		 797 aa  74.3  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  27.55 
 
 		 650 aa  73.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  25 
 
 		 986 aa  73.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  23.08 
 
 		 1097 aa  73.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  26.58 
 
 		 633 aa  72.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  27.55 
 
 		 650 aa  72  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  22.22 
 
 		 636 aa  70.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  25.85 
 
 		 901 aa  70.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.22 
 
 		 1111 aa  69.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  23.97 
 
 		 635 aa  68.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.64 
 
 		 752 aa  68.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  25.43 
 
 		 686 aa  68.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  26.89 
 
 		 655 aa  68.6  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.64 
 
 		 1048 aa  68.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.36 
 
 		 609 aa  67.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  25.25 
 
 		 486 aa  67  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  25.74 
 
 		 1082 aa  66.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25.1 
 
 		 632 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.43 
 
 		 585 aa  64.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.67 
 
 		 1999 aa  63.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  27.1 
 
 		 633 aa  63.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1172 aa  62.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1247 aa  63.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  25.57 
 
 		 1077 aa  62.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  29.36 
 
 		 1041 aa  62.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  24.92 
 
 		 1651 aa  62.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.79 
 
 		 925 aa  62.4  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  24.89 
 
 		 1143 aa  61.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  23.12 
 
 		 759 aa  60.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  26.6 
 
 		 716 aa  60.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  27.51 
 
 		 946 aa  61.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  23.3 
 
 		 759 aa  59.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  23.3 
 
 		 759 aa  59.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  26.1 
 
 		 2245 aa  59.3  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  23.3 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  25.52 
 
 		 906 aa  58.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  24.53 
 
 		 1584 aa  58.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.28 
 
 		 1090 aa  58.5  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.12 
 
 		 759 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  24.94 
 
 		 1163 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  26.94 
 
 		 651 aa  58.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  27.89 
 
 		 619 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  25.85 
 
 		 1143 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  22.94 
 
 		 759 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  25.85 
 
 		 1143 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  26.26 
 
 		 479 aa  57.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  26.45 
 
 		 941 aa  57.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  23.12 
 
 		 759 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  22.75 
 
 		 759 aa  57  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  25.4 
 
 		 521 aa  57  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  23.78 
 
 		 759 aa  56.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25 
 
 		 952 aa  56.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  24.81 
 
 		 2098 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1139 aa  55.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  24.81 
 
 		 2098 aa  56.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  24.76 
 
 		 1270 aa  55.5  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.55 
 
 		 622 aa  55.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  24.39 
 
 		 1228 aa  55.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1215 aa  55.5  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  23.68 
 
 		 769 aa  55.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  26.87 
 
 		 622 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3925  hypothetical protein  28.72 
 
 		 183 aa  55.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  26.14 
 
 		 903 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  25 
 
 		 1018 aa  55.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  40.58 
 
 		 928 aa  53.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  22.45 
 
 		 769 aa  54.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  25.61 
 
 		 1958 aa  53.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1121 aa  53.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1822 aa  52.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  24.27 
 
 		 1697 aa  52.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.81 
 
 		 1324 aa  52.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  40.58 
 
 		 758 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  23.9 
 
 		 916 aa  52  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>