139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0634 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1584 aa  3270    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2072  hypothetical protein  77.93 
 
 		 221 aa  348  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.506515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  30.51 
 
 		 412 aa  115  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  30.07 
 
 		 1041 aa  87.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  26.23 
 
 		 2543 aa  87.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.64 
 
 		 1038 aa  84.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  24.49 
 
 		 1261 aa  83.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1625 aa  80.5  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2990  putative ATPase  26.01 
 
 		 1406 aa  73.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  24.48 
 
 		 1403 aa  74.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  23.62 
 
 		 585 aa  72.8  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  23.82 
 
 		 635 aa  72.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  23.32 
 
 		 1136 aa  70.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0197  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1414 aa  70.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  28.21 
 
 		 769 aa  68.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.18 
 
 		 1196 aa  68.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.5 
 
 		 629 aa  67.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  23.39 
 
 		 606 aa  67.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  24.45 
 
 		 659 aa  67.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  23 
 
 		 1126 aa  66.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  22.4 
 
 		 1111 aa  65.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  27.44 
 
 		 759 aa  64.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1116 aa  64.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  27.14 
 
 		 759 aa  65.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 946 aa  64.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  27.14 
 
 		 759 aa  64.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  27.14 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  27.14 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  27.14 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  27.14 
 
 		 759 aa  63.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  27.14 
 
 		 769 aa  62.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  23.86 
 
 		 611 aa  62.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  27.92 
 
 		 1185 aa  62.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.79 
 
 		 759 aa  62  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  26.79 
 
 		 759 aa  62  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  26.37 
 
 		 1651 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  24.22 
 
 		 715 aa  60.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1350 aa  60.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  24.04 
 
 		 934 aa  60.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  26.37 
 
 		 1999 aa  59.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  24.53 
 
 		 1457 aa  58.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  24.01 
 
 		 941 aa  58.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.09 
 
 		 609 aa  58.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.68 
 
 		 932 aa  58.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1247 aa  57.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  26.99 
 
 		 650 aa  57.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.74 
 
 		 1428 aa  57  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  27.65 
 
 		 1137 aa  56.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  24.03 
 
 		 1082 aa  57  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  22.44 
 
 		 1284 aa  56.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  21.86 
 
 		 916 aa  56.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  25.09 
 
 		 1157 aa  56.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  21.84 
 
 		 986 aa  56.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25.76 
 
 		 636 aa  56.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  23.73 
 
 		 922 aa  56.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1118 aa  55.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  27.82 
 
 		 2245 aa  55.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  24.17 
 
 		 902 aa  54.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  22.37 
 
 		 797 aa  55.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  22.53 
 
 		 1270 aa  54.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1139 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  24.91 
 
 		 643 aa  55.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  26.26 
 
 		 650 aa  55.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  24.76 
 
 		 1408 aa  53.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  26.35 
 
 		 1653 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1018 aa  53.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  27.37 
 
 		 1132 aa  53.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1215 aa  53.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  23.48 
 
 		 1178 aa  53.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  22.75 
 
 		 752 aa  53.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  24.16 
 
 		 268 aa  53.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  33.33 
 
 		 1056 aa  53.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  26.16 
 
 		 633 aa  53.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 1687 aa  53.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  26.16 
 
 		 925 aa  52.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  23.65 
 
 		 975 aa  52.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.5 
 
 		 1324 aa  52.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.19 
 
 		 636 aa  52.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 1672 aa  52.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  23.95 
 
 		 686 aa  52.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5354  hypothetical protein  23.32 
 
 		 2593 aa  52  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.406215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  22.38 
 
 		 1094 aa  52  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  27.08 
 
 		 655 aa  51.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  21.21 
 
 		 1087 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1215 aa  51.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  21.98 
 
 		 901 aa  51.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  22.7 
 
 		 1585 aa  51.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.4 
 
 		 1099 aa  51.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  22.7 
 
 		 1585 aa  51.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  22.68 
 
 		 1090 aa  51.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  22.15 
 
 		 1620 aa  50.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  21.99 
 
 		 1178 aa  50.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  20.88 
 
 		 1153 aa  50.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  24.61 
 
 		 914 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.8 
 
 		 1097 aa  50.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  23.38 
 
 		 1143 aa  50.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0731  hypothetical protein  24.78 
 
 		 583 aa  49.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27.08 
 
 		 633 aa  49.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  23.13 
 
 		 1280 aa  49.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.61 
 
 		 1477 aa  49.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>