32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1474 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  100 
 
 		 1625 aa  3351    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07280  conserved hypothetical protein  27.79 
 
 		 1882 aa  129  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.955647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  28.1 
 
 		 2543 aa  96.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 1687 aa  96.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  27.03 
 
 		 412 aa  92  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  24.28 
 
 		 1672 aa  87  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  22.71 
 
 		 1584 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0731  hypothetical protein  23.86 
 
 		 583 aa  70.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1934 aa  65.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  27.72 
 
 		 985 aa  64.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2990  putative ATPase  22.82 
 
 		 1406 aa  61.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  27.47 
 
 		 628 aa  57.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2133  hypothetical protein  21.79 
 
 		 554 aa  56.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1012 aa  56.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  27.17 
 
 		 942 aa  55.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1034 aa  53.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0197  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1414 aa  52.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  30.48 
 
 		 630 aa  52  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1284 aa  50.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  28.81 
 
 		 598 aa  51.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2463  HSP90 family protein  32.23 
 
 		 621 aa  50.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0779682  decreased coverage  0.00689697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  27.56 
 
 		 1084 aa  49.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  24.1 
 
 		 634 aa  47.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  27.47 
 
 		 628 aa  47.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 		 594 aa  47  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  26.09 
 
 		 630 aa  46.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  25.64 
 
 		 635 aa  46.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0703  heat shock protein 90  28.36 
 
 		 609 aa  46.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1043 aa  45.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0814  heat shock protein 90  25.13 
 
 		 632 aa  45.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24906  predicted protein  33.93 
 
 		 484 aa  45.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  25.13 
 
 		 634 aa  45.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>