24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8899 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  47.97 
 
 
1029 aa  731    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  45.41 
 
 
1084 aa  698    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  70.71 
 
 
985 aa  1348    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  100 
 
 
1043 aa  1958    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  55.77 
 
 
1034 aa  882    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  45.33 
 
 
1067 aa  622  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  36.81 
 
 
1202 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  43.51 
 
 
1030 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  37.14 
 
 
1012 aa  379  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  38.5 
 
 
942 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  41.63 
 
 
1026 aa  348  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  35.31 
 
 
1315 aa  344  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  35.88 
 
 
946 aa  331  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  35.1 
 
 
1017 aa  275  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  34.22 
 
 
1082 aa  271  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  40.79 
 
 
985 aa  253  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  34.05 
 
 
847 aa  233  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  32.23 
 
 
940 aa  214  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  40.65 
 
 
1284 aa  198  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  27.13 
 
 
1306 aa  82  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  29.79 
 
 
412 aa  54.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  27.23 
 
 
1934 aa  50.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 
2543 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  26.83 
 
 
1625 aa  47.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>