21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  100 
 
 		 1082 aa  2006    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1026 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  38.42 
 
 		 1034 aa  392  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  38.78 
 
 		 1017 aa  354  5.9999999999999994e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  36.17 
 
 		 985 aa  352  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  34.55 
 
 		 1084 aa  301  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1029 aa  299  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1043 aa  290  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  43.45 
 
 		 1284 aa  250  9e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  36.22 
 
 		 942 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  41.24 
 
 		 1030 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  32.34 
 
 		 946 aa  215  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1012 aa  207  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  33.38 
 
 		 1202 aa  206  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  37.45 
 
 		 1315 aa  181  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  34.42 
 
 		 940 aa  148  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  33.38 
 
 		 847 aa  147  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  33.87 
 
 		 1067 aa  71.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1306 aa  58.9  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2133  hypothetical protein  21.53 
 
 		 554 aa  57.4  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1934 aa  47.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>