26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3292 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  50.78 
 
 
1029 aa  775    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  47.24 
 
 
1084 aa  741    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  100 
 
 
985 aa  1868    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  70.71 
 
 
1043 aa  1295    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  56.34 
 
 
1034 aa  895    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  47.27 
 
 
1067 aa  669    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  37.31 
 
 
1202 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  44.9 
 
 
1030 aa  465  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  39.32 
 
 
1012 aa  415  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  40.1 
 
 
942 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  41.75 
 
 
1026 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  34.82 
 
 
1315 aa  363  9e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  36.73 
 
 
946 aa  339  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  36.21 
 
 
1082 aa  302  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  35.71 
 
 
1017 aa  285  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  41.17 
 
 
985 aa  278  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  34.5 
 
 
847 aa  254  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  36.16 
 
 
940 aa  224  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  43.72 
 
 
1284 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  27.19 
 
 
1306 aa  72.8  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  35.03 
 
 
1934 aa  71.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  26.09 
 
 
1625 aa  64.3  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  27.66 
 
 
412 aa  57.4  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 
1672 aa  52.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  30.26 
 
 
2543 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2133  hypothetical protein  21.12 
 
 
554 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>