25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2928 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  100 
 
 
1284 aa  2390    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  56.18 
 
 
1026 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  43.45 
 
 
1082 aa  258  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  42.92 
 
 
1034 aa  245  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  43.71 
 
 
985 aa  244  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  48.42 
 
 
1084 aa  231  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  45.8 
 
 
1067 aa  220  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  44.7 
 
 
1017 aa  212  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  40.04 
 
 
1043 aa  208  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  44.05 
 
 
1029 aa  198  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  43.34 
 
 
942 aa  188  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  32.43 
 
 
1202 aa  185  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  46.65 
 
 
1030 aa  182  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  42.51 
 
 
1012 aa  168  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  34.39 
 
 
1315 aa  151  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  40.35 
 
 
946 aa  146  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  45.73 
 
 
985 aa  143  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  36.66 
 
 
940 aa  129  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  41.27 
 
 
847 aa  124  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  28.63 
 
 
1306 aa  74.3  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  33.86 
 
 
412 aa  55.1  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  28.71 
 
 
1625 aa  53.5  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  29.22 
 
 
1934 aa  51.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  32.8 
 
 
2543 aa  49.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2133  hypothetical protein  22.48 
 
 
554 aa  47.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>