22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0237 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  100 
 
 
1029 aa  1957    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  54.2 
 
 
1084 aa  953    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  50.78 
 
 
985 aa  817    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  47.97 
 
 
1043 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  51.99 
 
 
1034 aa  813    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  44.58 
 
 
1067 aa  630  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  36.96 
 
 
1202 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  42.54 
 
 
1030 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  39.54 
 
 
942 aa  406  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  36.5 
 
 
1012 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  40.2 
 
 
1026 aa  356  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  37.56 
 
 
1017 aa  335  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  36.05 
 
 
946 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  35.58 
 
 
940 aa  298  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  34.81 
 
 
1082 aa  294  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  34.28 
 
 
847 aa  259  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  40.28 
 
 
985 aa  232  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  42.07 
 
 
1315 aa  209  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  44.72 
 
 
1284 aa  203  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  24.46 
 
 
1306 aa  75.1  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  33.33 
 
 
1934 aa  52.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  31.4 
 
 
412 aa  44.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>