22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3582 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  100 
 
 		 985 aa  1781    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  40.74 
 
 		 985 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1034 aa  385  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  42.54 
 
 		 1026 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  39.91 
 
 		 1084 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  39.96 
 
 		 1043 aa  348  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  40.87 
 
 		 1067 aa  307  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  37.56 
 
 		 1029 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1017 aa  280  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  36.87 
 
 		 1012 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  42.76 
 
 		 1030 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  38.27 
 
 		 942 aa  226  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  33.22 
 
 		 1202 aa  212  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  35.38 
 
 		 946 aa  187  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  32.12 
 
 		 1315 aa  162  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  45.12 
 
 		 1284 aa  157  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  33.88 
 
 		 940 aa  153  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  32.91 
 
 		 847 aa  122  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1306 aa  62.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1082 aa  58.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1625 aa  54.7  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1934 aa  47.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>