26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3709 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  100 
 
 		 1306 aa  2638    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  30.91 
 
 		 1084 aa  108  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1067 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  31.95 
 
 		 1026 aa  82  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1034 aa  78.6  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2133  hypothetical protein  24.14 
 
 		 554 aa  77  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  35.95 
 
 		 1012 aa  76.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  28.53 
 
 		 942 aa  73.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  27.19 
 
 		 985 aa  72.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1043 aa  72  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  35.77 
 
 		 1284 aa  69.3  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  36.84 
 
 		 940 aa  63.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  40 
 
 		 847 aa  63.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  36.76 
 
 		 1202 aa  62.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  36.23 
 
 		 946 aa  60.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1017 aa  58.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1029 aa  58.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  22.57 
 
 		 412 aa  56.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1030 aa  56.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  23.08 
 
 		 1687 aa  52.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  25.6 
 
 		 1315 aa  48.9  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  18.8 
 
 		 1672 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  35.9 
 
 		 469 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  40 
 
 		 539 aa  45.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  40.3 
 
 		 985 aa  45.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  24.32 
 
 		 2543 aa  45.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>