26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7212 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  57.03 
 
 
1202 aa  1020    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  100 
 
 
1315 aa  2462    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  38.36 
 
 
1034 aa  443  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  35.5 
 
 
985 aa  422  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  36.07 
 
 
1043 aa  382  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  36.26 
 
 
1029 aa  375  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  34.19 
 
 
1084 aa  339  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  36.18 
 
 
1030 aa  256  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  33.98 
 
 
942 aa  254  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  41.03 
 
 
1067 aa  218  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  39.62 
 
 
1026 aa  217  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  41.18 
 
 
1012 aa  197  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  34.65 
 
 
1082 aa  194  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  30.58 
 
 
946 aa  180  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  31.32 
 
 
1017 aa  175  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  30.31 
 
 
940 aa  171  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  34.39 
 
 
1284 aa  163  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  38.57 
 
 
985 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  28.55 
 
 
847 aa  89.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  30.13 
 
 
1934 aa  62  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  25.84 
 
 
1306 aa  61.6  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2987  ATP-binding region ATPase domain protein  37.96 
 
 
622 aa  50.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0695  HSP90 family protein  36.07 
 
 
643 aa  48.5  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  34.69 
 
 
412 aa  47.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  38.74 
 
 
598 aa  46.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23120  molecular chaperone of HSP90 family  40.28 
 
 
641 aa  46.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>