29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3837 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  100 
 
 		 1030 aa  1865    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  48.61 
 
 		 1034 aa  625  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  45.09 
 
 		 985 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  43.55 
 
 		 1084 aa  547  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  43.6 
 
 		 1043 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  43 
 
 		 1029 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  41.85 
 
 		 1067 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  44.84 
 
 		 942 aa  479  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  37.81 
 
 		 1202 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  40 
 
 		 1012 aa  386  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  39.94 
 
 		 946 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  45.34 
 
 		 1026 aa  344  5.999999999999999e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  38.95 
 
 		 847 aa  311  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  36.08 
 
 		 1315 aa  295  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  37.78 
 
 		 940 aa  278  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  43.25 
 
 		 985 aa  250  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  41.5 
 
 		 1082 aa  248  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1017 aa  236  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  47.16 
 
 		 1284 aa  205  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1306 aa  91.7  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2133  hypothetical protein  21.58 
 
 		 554 aa  57.4  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  29.23 
 
 		 2543 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  24.88 
 
 		 412 aa  55.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1625 aa  55.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1934 aa  54.7  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0731  hypothetical protein  25.85 
 
 		 583 aa  49.7  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  36.29 
 
 		 589 aa  46.2  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2463  HSP90 family protein  28.04 
 
 		 621 aa  45.8  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0779682  decreased coverage  0.00689697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  31.78 
 
 		 613 aa  45.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>