23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4727 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  100 
 
 
1012 aa  1894    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  40.44 
 
 
942 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  39.62 
 
 
985 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  39.25 
 
 
1034 aa  432  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  37 
 
 
1084 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  36.18 
 
 
1043 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  37.93 
 
 
946 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  36.1 
 
 
1029 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  36.8 
 
 
1067 aa  352  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  38.55 
 
 
1030 aa  328  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  35.61 
 
 
940 aa  300  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  37.3 
 
 
1026 aa  281  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  34.91 
 
 
847 aa  241  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  30.08 
 
 
1202 aa  238  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  33.81 
 
 
1017 aa  234  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  35.61 
 
 
1082 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  38.8 
 
 
985 aa  184  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  41.18 
 
 
1315 aa  174  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  42.86 
 
 
1284 aa  155  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  35.95 
 
 
1306 aa  77  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  25.31 
 
 
1625 aa  56.2  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  37.66 
 
 
2543 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  25 
 
 
1672 aa  55.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>