25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0830 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  100 
 
 		 847 aa  1608    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  40.15 
 
 		 940 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  39.27 
 
 		 942 aa  332  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  37.49 
 
 		 946 aa  300  7e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  34.71 
 
 		 985 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  33.57 
 
 		 1084 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  34.7 
 
 		 1012 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1034 aa  207  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  41.48 
 
 		 1026 aa  188  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  37.2 
 
 		 1030 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1043 aa  163  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1029 aa  157  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  34.64 
 
 		 1067 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  34.45 
 
 		 1082 aa  142  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  39.7 
 
 		 1284 aa  135  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1017 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  46 
 
 		 1202 aa  99  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  38.26 
 
 		 1315 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  40 
 
 		 1306 aa  77.8  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  48.7 
 
 		 985 aa  71.2  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1934 aa  59.3  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2133  hypothetical protein  30.91 
 
 		 554 aa  48.5  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 1687 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  31.46 
 
 		 412 aa  44.3  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  36.9 
 
 		 625 aa  44.3  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>