34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2613 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  850    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  30.51 
 
 		 1584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  29.64 
 
 		 2543 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1625 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  24.85 
 
 		 1672 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 1687 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0197  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1414 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2990  putative ATPase  24.6 
 
 		 1406 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  27.66 
 
 		 985 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1306 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  33.86 
 
 		 1284 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5354  hypothetical protein  23.77 
 
 		 2593 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.406215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  36.26 
 
 		 1084 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1006  heat shock protein 90  25.14 
 
 		 612 aa  53.5  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.511721  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1034 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0234  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1853 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.349944  decreased coverage  0.00142458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1043 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  24.37 
 
 		 634 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  24.37 
 
 		 634 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  29.61 
 
 		 610 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07280  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 		 1882 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.955647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  23.78 
 
 		 634 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0731  hypothetical protein  26.67 
 
 		 583 aa  46.6  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  27.93 
 
 		 611 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  23.86 
 
 		 634 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  27.93 
 
 		 611 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1934 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06551  HATPase_c domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04830)  26.85 
 
 		 1734 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_55215  heat shock protein Hsp90  26.57 
 
 		 780 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02610  conserved expressed protein  33.02 
 
 		 1731 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  23.35 
 
 		 635 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1026 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0703  heat shock protein 90  24.63 
 
 		 609 aa  43.9  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  23.35 
 
 		 634 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>