298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5467 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  73.89 
 
 
611 aa  894    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  100 
 
 
610 aa  1224    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  73.66 
 
 
611 aa  874    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  68.08 
 
 
629 aa  813    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  75.87 
 
 
626 aa  914    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  75.21 
 
 
626 aa  901    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  75.54 
 
 
626 aa  907    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  61.94 
 
 
606 aa  729    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  50 
 
 
626 aa  589  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  50.24 
 
 
631 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  49.51 
 
 
628 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  49.43 
 
 
624 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  49.84 
 
 
628 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  46.45 
 
 
630 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  47.18 
 
 
637 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  49.18 
 
 
628 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  47.29 
 
 
657 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  48.22 
 
 
638 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4929  heat shock protein 90  49.17 
 
 
620 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.621243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  46.73 
 
 
628 aa  548  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  46.73 
 
 
628 aa  548  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  45.7 
 
 
643 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  48.38 
 
 
630 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  46.53 
 
 
636 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  45.43 
 
 
633 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1910  heat shock protein 90  45.31 
 
 
650 aa  515  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  43.26 
 
 
630 aa  514  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  45.34 
 
 
629 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  45.25 
 
 
626 aa  505  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  44.76 
 
 
634 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0466  heat shock protein 90  44.44 
 
 
650 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  44.11 
 
 
630 aa  505  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  44.44 
 
 
650 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  45.09 
 
 
634 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  44.78 
 
 
632 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  44.09 
 
 
652 aa  502  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4289  heat shock protein 90  44.44 
 
 
668 aa  500  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  45.87 
 
 
633 aa  500  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  45.71 
 
 
628 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  43.85 
 
 
650 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  45.19 
 
 
632 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  45.79 
 
 
632 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  43.6 
 
 
638 aa  495  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  45.19 
 
 
632 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  45.95 
 
 
632 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  45.19 
 
 
632 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  43.52 
 
 
639 aa  495  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  45.08 
 
 
632 aa  498  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  45.63 
 
 
632 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  43.31 
 
 
639 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  45.03 
 
 
632 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  45.35 
 
 
632 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  45.19 
 
 
632 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  45.19 
 
 
632 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  43.92 
 
 
638 aa  495  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  40.97 
 
 
644 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  45.63 
 
 
632 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  39.81 
 
 
623 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  43.06 
 
 
635 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  44.97 
 
 
633 aa  495  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  45.63 
 
 
632 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  44.13 
 
 
632 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  45.63 
 
 
632 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  45.17 
 
 
643 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  44.48 
 
 
624 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  44.48 
 
 
624 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  44.11 
 
 
633 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  43.69 
 
 
638 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  44.99 
 
 
632 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  43.34 
 
 
624 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  43.34 
 
 
624 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  44.03 
 
 
633 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  43.34 
 
 
624 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  43.34 
 
 
624 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  42.9 
 
 
634 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  44.88 
 
 
633 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  43 
 
 
634 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  43.42 
 
 
640 aa  488  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  44.48 
 
 
622 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  44.19 
 
 
629 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  43.67 
 
 
637 aa  487  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  43.34 
 
 
624 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  43.34 
 
 
624 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  43.34 
 
 
624 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  43.34 
 
 
624 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  42.42 
 
 
634 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  45.03 
 
 
643 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  43.23 
 
 
634 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  43.34 
 
 
624 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  43.16 
 
 
634 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  42.1 
 
 
634 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  43.75 
 
 
634 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  42.6 
 
 
635 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0551  heat shock protein 90  43.29 
 
 
634 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  43.55 
 
 
629 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  43.83 
 
 
640 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  45.67 
 
 
623 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  43.23 
 
 
634 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  40.84 
 
 
645 aa  485  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  43.78 
 
 
637 aa  485  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>