297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4673 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  52.17 
 
 
624 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1910  heat shock protein 90  54.95 
 
 
650 aa  706    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  64.48 
 
 
637 aa  844    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  64.85 
 
 
630 aa  832    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  58 
 
 
657 aa  740    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  52.46 
 
 
628 aa  638    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  65.87 
 
 
630 aa  862    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  63.33 
 
 
638 aa  824    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  51.35 
 
 
628 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  69.09 
 
 
643 aa  908    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  100 
 
 
631 aa  1287    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  53.33 
 
 
626 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  51.82 
 
 
628 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4929  heat shock protein 90  51.51 
 
 
620 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.621243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  50.24 
 
 
629 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  50.08 
 
 
610 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  50.08 
 
 
626 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  50.16 
 
 
626 aa  558  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  49.43 
 
 
626 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  48.07 
 
 
611 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  48.7 
 
 
611 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  42.14 
 
 
637 aa  539  9.999999999999999e-153  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  44.09 
 
 
634 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  44.99 
 
 
629 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  44.25 
 
 
634 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  43.62 
 
 
634 aa  528  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  45.6 
 
 
628 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  44.25 
 
 
634 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  44.09 
 
 
634 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  44.99 
 
 
629 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  44.53 
 
 
636 aa  528  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0237  heat shock protein 90  41.81 
 
 
637 aa  525  1e-148  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.528413  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  44.08 
 
 
633 aa  528  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  43.94 
 
 
634 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  44.44 
 
 
626 aa  526  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  43.92 
 
 
652 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  43.87 
 
 
637 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  43.78 
 
 
634 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  46.31 
 
 
632 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  42.2 
 
 
635 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  43.27 
 
 
628 aa  525  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  43.27 
 
 
628 aa  525  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  45.44 
 
 
640 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  43.71 
 
 
635 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  46.15 
 
 
632 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  46.01 
 
 
630 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  46.15 
 
 
632 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  46.15 
 
 
632 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  46.15 
 
 
632 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  46.31 
 
 
632 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  46.66 
 
 
634 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  45.67 
 
 
632 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  43.78 
 
 
634 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  46 
 
 
632 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0466  heat shock protein 90  44.09 
 
 
650 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  44.62 
 
 
643 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  44.09 
 
 
650 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  46.15 
 
 
632 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  46.49 
 
 
632 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0266  heat shock protein 90  43.51 
 
 
636 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.48191  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  44.94 
 
 
647 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  45.4 
 
 
632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  45.6 
 
 
633 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  45.07 
 
 
632 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  45.23 
 
 
632 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  45.37 
 
 
632 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  42.9 
 
 
640 aa  512  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  45.37 
 
 
632 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  44.31 
 
 
643 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0296  heat shock protein 90  43.82 
 
 
636 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00313  heat shock protein 90  43.73 
 
 
634 aa  512  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  43.98 
 
 
624 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  43.98 
 
 
624 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  43.91 
 
 
633 aa  510  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  41.92 
 
 
635 aa  510  1e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  44.62 
 
 
640 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  43.98 
 
 
624 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  43.98 
 
 
624 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  43.93 
 
 
634 aa  509  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  43.98 
 
 
624 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  43.98 
 
 
624 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  43.98 
 
 
624 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0495  heat shock protein 90  42.23 
 
 
620 aa  510  1e-143  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  44.57 
 
 
626 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  44.97 
 
 
633 aa  512  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19170  heat shock protein 90  43.55 
 
 
635 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000174366  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  44.03 
 
 
642 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  43.98 
 
 
624 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4289  heat shock protein 90  43.4 
 
 
668 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  43.8 
 
 
630 aa  508  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  43.82 
 
 
624 aa  507  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  45.07 
 
 
632 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  44.67 
 
 
629 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  43.41 
 
 
623 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  43.25 
 
 
623 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  42.25 
 
 
639 aa  502  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  42.21 
 
 
650 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  46.12 
 
 
606 aa  500  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  41.77 
 
 
639 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  41.89 
 
 
626 aa  499  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>