290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1910 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  53.55 
 
 
643 aa  705    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  69.45 
 
 
657 aa  940    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  50.71 
 
 
630 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  54.66 
 
 
631 aa  710    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  53.6 
 
 
637 aa  711    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1910  heat shock protein 90  100 
 
 
650 aa  1311    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  54.98 
 
 
638 aa  710    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  53.93 
 
 
630 aa  679    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  48.69 
 
 
624 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  48.6 
 
 
628 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  46.75 
 
 
628 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4929  heat shock protein 90  48.07 
 
 
620 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.621243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  48.3 
 
 
628 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  45.48 
 
 
626 aa  555  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  46.42 
 
 
629 aa  531  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  47.51 
 
 
626 aa  528  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  47.35 
 
 
626 aa  525  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  46.87 
 
 
626 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  45.97 
 
 
610 aa  522  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  40.25 
 
 
637 aa  506  9.999999999999999e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  44.65 
 
 
611 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0237  heat shock protein 90  39.32 
 
 
637 aa  492  9.999999999999999e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.528413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  45.61 
 
 
611 aa  485  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  40.94 
 
 
634 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  39.69 
 
 
623 aa  480  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  38.46 
 
 
635 aa  477  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  40.7 
 
 
634 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0495  heat shock protein 90  37.69 
 
 
620 aa  477  1e-133  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  40.68 
 
 
628 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  40.68 
 
 
628 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  41.62 
 
 
633 aa  475  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  39.94 
 
 
634 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  40.3 
 
 
652 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2480  heat shock protein 90  39.3 
 
 
640 aa  467  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19170  heat shock protein 90  41.58 
 
 
635 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000174366  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  38.72 
 
 
626 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  40.39 
 
 
634 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  40 
 
 
634 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  40.43 
 
 
640 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  39.61 
 
 
635 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  39.76 
 
 
637 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  39.85 
 
 
634 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  39.85 
 
 
634 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  38.24 
 
 
635 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  43.19 
 
 
606 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  40.7 
 
 
634 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  39.33 
 
 
636 aa  458  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0466  heat shock protein 90  38.94 
 
 
650 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  39.33 
 
 
626 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  40.09 
 
 
634 aa  458  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  39.82 
 
 
642 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  40 
 
 
628 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  38.41 
 
 
630 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  38.94 
 
 
650 aa  458  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0266  heat shock protein 90  40.21 
 
 
636 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.48191  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0296  heat shock protein 90  40.21 
 
 
636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  40.15 
 
 
633 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  38.14 
 
 
650 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4289  heat shock protein 90  38.88 
 
 
668 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  39.24 
 
 
629 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  39.28 
 
 
647 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  40.39 
 
 
632 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  40.45 
 
 
632 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  39.64 
 
 
630 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  40.24 
 
 
632 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  40.24 
 
 
632 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  40.24 
 
 
632 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  40.24 
 
 
632 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  40.3 
 
 
632 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  39.73 
 
 
634 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  38.06 
 
 
644 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  40.24 
 
 
632 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  40.24 
 
 
632 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  38.79 
 
 
629 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  36.58 
 
 
642 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  40.09 
 
 
632 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  40.39 
 
 
632 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  38.79 
 
 
629 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  39.09 
 
 
643 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3701  Heat shock protein Hsp90-like protein  40.15 
 
 
640 aa  445  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93558  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  40.15 
 
 
632 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  40.15 
 
 
632 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  38.94 
 
 
643 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  40.15 
 
 
632 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  39.03 
 
 
640 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  38.37 
 
 
634 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00313  heat shock protein 90  39.76 
 
 
634 aa  442  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  36.99 
 
 
630 aa  442  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  38.59 
 
 
639 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  38.2 
 
 
633 aa  442  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1997  heat shock protein 90  38.5 
 
 
619 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  40.39 
 
 
632 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  38.2 
 
 
633 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0958  heat shock protein 90  37.52 
 
 
617 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0551  heat shock protein 90  38.84 
 
 
634 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5294  heat shock protein 90  39.3 
 
 
636 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117014  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  39.43 
 
 
632 aa  439  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  37.59 
 
 
645 aa  439  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4976  heat shock protein 90  36.24 
 
 
678 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144438  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0484  heat shock protein 90  37.86 
 
 
662 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>