295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0072 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  100 
 
 
626 aa  1269    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  53.01 
 
 
643 aa  631  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  52.54 
 
 
631 aa  618  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  51.93 
 
 
629 aa  606  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0237  heat shock protein 90  47.31 
 
 
637 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.528413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  50.87 
 
 
637 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  51.27 
 
 
630 aa  601  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  46.17 
 
 
635 aa  597  1e-169  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  46.36 
 
 
637 aa  596  1e-169  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  49.21 
 
 
638 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  51.13 
 
 
626 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  50.81 
 
 
626 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  50.65 
 
 
626 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  49.84 
 
 
610 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  48.52 
 
 
634 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  49.05 
 
 
630 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  48.37 
 
 
630 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  49.52 
 
 
624 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  49.53 
 
 
640 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  47.45 
 
 
628 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0466  heat shock protein 90  47.15 
 
 
650 aa  571  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  49.45 
 
 
628 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  49.07 
 
 
643 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  47.15 
 
 
650 aa  571  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  49.3 
 
 
632 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  49.14 
 
 
632 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  49.3 
 
 
632 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  48.11 
 
 
633 aa  565  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  49.14 
 
 
632 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  48.06 
 
 
632 aa  568  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  49.3 
 
 
632 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  47.37 
 
 
650 aa  565  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  47.62 
 
 
628 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  47.96 
 
 
632 aa  568  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  48.03 
 
 
634 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  49.14 
 
 
632 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  49.14 
 
 
632 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  48.76 
 
 
643 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  49.14 
 
 
632 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  48.91 
 
 
632 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  47.65 
 
 
626 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  48.98 
 
 
634 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  48.36 
 
 
633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  48.67 
 
 
633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  48.03 
 
 
634 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  48.16 
 
 
611 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  48.91 
 
 
632 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  48.68 
 
 
632 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  47.24 
 
 
634 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  47.56 
 
 
634 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  49.27 
 
 
611 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  46.41 
 
 
630 aa  560  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  46.64 
 
 
626 aa  561  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  48.91 
 
 
632 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  47.4 
 
 
634 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  47.68 
 
 
647 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  48.91 
 
 
632 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  47.15 
 
 
624 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  47.15 
 
 
624 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  47.15 
 
 
624 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  47.25 
 
 
637 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  47.96 
 
 
636 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  45.08 
 
 
644 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  47.32 
 
 
634 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  48.37 
 
 
632 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  47.15 
 
 
624 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  47.72 
 
 
634 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  49.14 
 
 
623 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  46.54 
 
 
628 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  46.54 
 
 
628 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  47.15 
 
 
624 aa  557  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  48.1 
 
 
628 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  47.15 
 
 
624 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  48.21 
 
 
632 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  47.34 
 
 
633 aa  558  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  47.15 
 
 
624 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  47.15 
 
 
624 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  46.31 
 
 
645 aa  558  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  48.33 
 
 
630 aa  555  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  47.1 
 
 
629 aa  558  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  46.99 
 
 
624 aa  554  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  47.41 
 
 
635 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  46.52 
 
 
624 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  47.95 
 
 
629 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  45.94 
 
 
639 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  46.68 
 
 
624 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  45.9 
 
 
635 aa  555  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  46.52 
 
 
624 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  46.3 
 
 
626 aa  554  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  46.52 
 
 
624 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  46.52 
 
 
637 aa  554  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  47.95 
 
 
629 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4289  heat shock protein 90  46.69 
 
 
668 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  46.66 
 
 
637 aa  549  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  46.14 
 
 
629 aa  549  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1910  heat shock protein 90  45.48 
 
 
650 aa  550  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  46 
 
 
657 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  46.56 
 
 
637 aa  551  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  46.36 
 
 
624 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  46.96 
 
 
642 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>