291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4692 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  52.46 
 
 		 631 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  88.69 
 
 		 628 aa  1149    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  53.02 
 
 		 637 aa  653    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  53.41 
 
 		 630 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  76.37 
 
 		 624 aa  957    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  100 
 
 		 628 aa  1267    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4929  heat shock protein 90  83.04 
 
 		 620 aa  1026    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.621243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  93.31 
 
 		 628 aa  1155    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  51.81 
 
 		 638 aa  648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  50.38 
 
 		 657 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  51.92 
 
 		 630 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  50.55 
 
 		 643 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1910  heat shock protein 90  48.45 
 
 		 650 aa  588  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  47.62 
 
 		 626 aa  567  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  49.51 
 
 		 610 aa  561  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  48.78 
 
 		 629 aa  554  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  49.18 
 
 		 611 aa  545  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  47.46 
 
 		 626 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  47.48 
 
 		 626 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  47.32 
 
 		 626 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  44.16 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  45.85 
 
 		 628 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  45.85 
 
 		 628 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  48.26 
 
 		 611 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  45.79 
 
 		 628 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  44.6 
 
 		 636 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  45.58 
 
 		 633 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  46.26 
 
 		 632 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  46.26 
 
 		 632 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  44.2 
 
 		 652 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  44.6 
 
 		 633 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  45.95 
 
 		 632 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  45.02 
 
 		 623 aa  509  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  46.08 
 
 		 632 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  46.08 
 
 		 632 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  45.92 
 
 		 632 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  46.08 
 
 		 632 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  46.08 
 
 		 632 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  46.08 
 
 		 632 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  46.08 
 
 		 632 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  46.08 
 
 		 632 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  46.11 
 
 		 632 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  42.45 
 
 		 637 aa  505  9.999999999999999e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  45.95 
 
 		 632 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  45.95 
 
 		 632 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  44.14 
 
 		 644 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  45.12 
 
 		 640 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  43.73 
 
 		 634 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0237  heat shock protein 90  42.56 
 
 		 637 aa  499  1e-140  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.528413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  42.06 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  45.04 
 
 		 606 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  45.79 
 
 		 632 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  43.1 
 
 		 645 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  44.46 
 
 		 629 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  43.91 
 
 		 630 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  43.04 
 
 		 634 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  42.63 
 
 		 634 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  44.46 
 
 		 629 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  44.34 
 
 		 629 aa  498  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  44.86 
 
 		 632 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  44.03 
 
 		 626 aa  495  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  44.13 
 
 		 634 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  44 
 
 		 643 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  43.19 
 
 		 635 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  43.29 
 
 		 623 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  42.28 
 
 		 637 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  42.57 
 
 		 634 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0495  heat shock protein 90  41.75 
 
 		 620 aa  489  1e-137  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  41.51 
 
 		 639 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  44.18 
 
 		 633 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  43.69 
 
 		 643 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  42.63 
 
 		 634 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  41.52 
 
 		 638 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  42.63 
 
 		 634 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  43.44 
 
 		 623 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  42.79 
 
 		 634 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  41.68 
 
 		 638 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  42.79 
 
 		 634 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  43.71 
 
 		 626 aa  485  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  44.01 
 
 		 639 aa  488  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19170  heat shock protein 90  43.59 
 
 		 635 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000174366  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  43.21 
 
 		 651 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  40.99 
 
 		 642 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  43.51 
 
 		 630 aa  488  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  42.48 
 
 		 634 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0466  heat shock protein 90  42.58 
 
 		 650 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  44.17 
 
 		 640 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  40.87 
 
 		 638 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  42.48 
 
 		 630 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1997  heat shock protein 90  42.99 
 
 		 619 aa  482  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  43.65 
 
 		 647 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  42.16 
 
 		 634 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  41.33 
 
 		 642 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  43.84 
 
 		 651 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  42.52 
 
 		 630 aa  485  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4289  heat shock protein 90  42.73 
 
 		 668 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2480  heat shock protein 90  42.39 
 
 		 640 aa  479  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  43.87 
 
 		 633 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  43.3 
 
 		 632 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  42.51 
 
 		 650 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>