295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1078 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  64.69 
 
 		 624 aa  836    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  64.69 
 
 		 624 aa  836    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  64.69 
 
 		 624 aa  836    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  61.87 
 
 		 634 aa  816    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  63.67 
 
 		 624 aa  823    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  66.93 
 
 		 632 aa  884    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  64.14 
 
 		 634 aa  848    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0266  heat shock protein 90  61.54 
 
 		 636 aa  804    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.48191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  64.25 
 
 		 640 aa  853    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  58.68 
 
 		 653 aa  796    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0296  heat shock protein 90  61.54 
 
 		 636 aa  804    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  61.33 
 
 		 637 aa  811    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  61.61 
 
 		 635 aa  811    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  66.45 
 
 		 632 aa  881    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  59.9 
 
 		 623 aa  798    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  59.74 
 
 		 623 aa  799    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  64.53 
 
 		 624 aa  834    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  61.65 
 
 		 637 aa  817    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  61.93 
 
 		 637 aa  810    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1719  heat shock protein 90  56.58 
 
 		 656 aa  748    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  71.9 
 
 		 636 aa  955    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3161  heat shock protein 90  64.23 
 
 		 625 aa  831    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144125 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  62.4 
 
 		 633 aa  813    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  64.56 
 
 		 633 aa  840    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  61.33 
 
 		 634 aa  774    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  100 
 
 		 633 aa  1296    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  63.34 
 
 		 624 aa  820    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  60.86 
 
 		 637 aa  809    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  66.45 
 
 		 632 aa  881    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  68.41 
 
 		 634 aa  891    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  61.39 
 
 		 634 aa  812    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  64.69 
 
 		 624 aa  834    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  66.77 
 
 		 632 aa  879    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  61.23 
 
 		 634 aa  806    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  68.36 
 
 		 632 aa  897    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  63.34 
 
 		 622 aa  821    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  67.89 
 
 		 632 aa  892    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  65.82 
 
 		 632 aa  866    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  61.55 
 
 		 634 aa  813    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  60.51 
 
 		 630 aa  784    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  61.55 
 
 		 634 aa  812    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0580  heat shock protein 90  56.31 
 
 		 653 aa  743    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.360532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  64.59 
 
 		 643 aa  857    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  72.56 
 
 		 639 aa  938    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  63.13 
 
 		 634 aa  831    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  66.45 
 
 		 632 aa  879    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  60.6 
 
 		 638 aa  811    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  61.93 
 
 		 650 aa  810    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  62.56 
 
 		 633 aa  816    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  60.28 
 
 		 638 aa  806    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3551  heat shock protein 90  59.46 
 
 		 663 aa  780    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  62.09 
 
 		 635 aa  837    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  62.82 
 
 		 634 aa  825    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  60.28 
 
 		 638 aa  806    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  78.98 
 
 		 628 aa  1036    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  78.98 
 
 		 628 aa  1036    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  60.99 
 
 		 626 aa  803    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  66.77 
 
 		 634 aa  880    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  61.49 
 
 		 637 aa  813    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  66.3 
 
 		 632 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  62.6 
 
 		 623 aa  796    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  60 
 
 		 632 aa  778    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  60.86 
 
 		 637 aa  809    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1998  heat shock protein 90  56.58 
 
 		 666 aa  744    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.154063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  63.92 
 
 		 633 aa  835    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0117  heat shock protein 90  53.29 
 
 		 631 aa  691    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  67.09 
 
 		 632 aa  885    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2894  heat shock protein 90  61.13 
 
 		 640 aa  793    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.511153  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  59.94 
 
 		 635 aa  774    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0551  heat shock protein 90  62.56 
 
 		 634 aa  805    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  66.45 
 
 		 632 aa  881    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  59.38 
 
 		 642 aa  795    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  61.24 
 
 		 626 aa  799    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  61.03 
 
 		 639 aa  818    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  61.49 
 
 		 637 aa  810    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  61.33 
 
 		 637 aa  808    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  62.68 
 
 		 652 aa  826    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1538  heat shock protein 90  60.22 
 
 		 637 aa  780    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0309955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  67.73 
 
 		 632 aa  879    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  61.71 
 
 		 634 aa  816    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  66.45 
 
 		 632 aa  881    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  67.09 
 
 		 632 aa  885    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  62.66 
 
 		 642 aa  794    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  61.01 
 
 		 637 aa  807    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  63.34 
 
 		 624 aa  820    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00313  heat shock protein 90  60.44 
 
 		 634 aa  803    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  60.86 
 
 		 637 aa  809    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  60.54 
 
 		 637 aa  808    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  66.45 
 
 		 632 aa  881    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0956  heat shock protein 90  59.46 
 
 		 634 aa  776    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.538924  normal  0.713469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  66.14 
 
 		 630 aa  882    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  62.12 
 
 		 630 aa  804    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  64.69 
 
 		 624 aa  836    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4289  heat shock protein 90  62.54 
 
 		 668 aa  819    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  61.94 
 
 		 629 aa  809    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  62.84 
 
 		 650 aa  814    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  66.45 
 
 		 632 aa  881    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0484  heat shock protein 90  61.35 
 
 		 662 aa  810    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  64.69 
 
 		 624 aa  836    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  60.19 
 
 		 633 aa  798    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>