293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1028 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  70.74 
 
 
611 aa  858    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  99.36 
 
 
626 aa  1250    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  75.87 
 
 
610 aa  913    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  58.92 
 
 
606 aa  687    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  65.79 
 
 
629 aa  783    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  71.8 
 
 
611 aa  885    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  100 
 
 
626 aa  1260    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  95.85 
 
 
626 aa  1187    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  51.13 
 
 
626 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  49.84 
 
 
631 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  48.48 
 
 
624 aa  554  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  48.24 
 
 
628 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  48.22 
 
 
657 aa  552  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  47.66 
 
 
628 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  49.11 
 
 
638 aa  548  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  47.35 
 
 
630 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  47.8 
 
 
637 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  46.87 
 
 
643 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  48.38 
 
 
630 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  45.9 
 
 
628 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  45.9 
 
 
628 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  46.83 
 
 
628 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1910  heat shock protein 90  47.28 
 
 
650 aa  525  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4929  heat shock protein 90  46.49 
 
 
620 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.621243 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  43.49 
 
 
630 aa  515  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  44.85 
 
 
636 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4289  heat shock protein 90  44.8 
 
 
668 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  46.39 
 
 
632 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  44.82 
 
 
633 aa  503  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  45.68 
 
 
632 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  45.34 
 
 
630 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  45.31 
 
 
632 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  46.1 
 
 
634 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  40.54 
 
 
635 aa  502  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  45.31 
 
 
632 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  45.47 
 
 
632 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  45.31 
 
 
632 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  45.53 
 
 
632 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  45.31 
 
 
632 aa  501  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0466  heat shock protein 90  44.04 
 
 
650 aa  500  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  45.3 
 
 
632 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  43.75 
 
 
650 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  45.16 
 
 
632 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  44.53 
 
 
652 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  45.31 
 
 
632 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  45.3 
 
 
632 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  44.04 
 
 
650 aa  501  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  45.31 
 
 
632 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  46.03 
 
 
628 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  45.3 
 
 
632 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  45.13 
 
 
634 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  45.21 
 
 
632 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  40.86 
 
 
623 aa  497  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  44.9 
 
 
632 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  43.72 
 
 
633 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  44.22 
 
 
629 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  40.28 
 
 
644 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  42.99 
 
 
639 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  40.41 
 
 
637 aa  491  1e-137  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  43.88 
 
 
626 aa  492  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  43.56 
 
 
633 aa  490  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  43.97 
 
 
633 aa  485  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4976  heat shock protein 90  42.31 
 
 
678 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  41.9 
 
 
645 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3161  heat shock protein 90  45.34 
 
 
625 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0144125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  44.38 
 
 
633 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  44.22 
 
 
633 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  43.49 
 
 
634 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  43.67 
 
 
634 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  43.75 
 
 
638 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0551  heat shock protein 90  43.8 
 
 
634 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  43.54 
 
 
640 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0237  heat shock protein 90  40.1 
 
 
637 aa  478  1e-133  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.528413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  44.05 
 
 
643 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  42.58 
 
 
635 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  43.89 
 
 
643 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  42.41 
 
 
634 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  42.25 
 
 
634 aa  475  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  42.7 
 
 
623 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  42.54 
 
 
623 aa  475  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  42.61 
 
 
637 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  42.25 
 
 
634 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  43.62 
 
 
632 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  42.88 
 
 
634 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  42.74 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  42.56 
 
 
634 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  43.75 
 
 
640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  42.74 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0484  heat shock protein 90  42.07 
 
 
662 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  42.74 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  42.88 
 
 
634 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  39.14 
 
 
644 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  42.43 
 
 
634 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  42.75 
 
 
639 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  42.74 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  42.58 
 
 
624 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  44.95 
 
 
623 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  42.74 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  42.74 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  42.53 
 
 
630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>