25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0486 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  49.08 
 
 		 946 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  100 
 
 		 942 aa  1768    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  41.42 
 
 		 1034 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  39.61 
 
 		 1012 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  40.48 
 
 		 985 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  40.82 
 
 		 940 aa  439  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  43.35 
 
 		 1030 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  39.9 
 
 		 1029 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  39.34 
 
 		 1084 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1043 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  36.57 
 
 		 1067 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  39.7 
 
 		 847 aa  362  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1202 aa  298  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  39.09 
 
 		 1026 aa  287  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1017 aa  253  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  33.81 
 
 		 1315 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  39.87 
 
 		 1082 aa  233  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  42.52 
 
 		 1284 aa  179  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  35.81 
 
 		 985 aa  169  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1306 aa  86.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1625 aa  62  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  31.96 
 
 		 2543 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  31 
 
 		 1584 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  28.41 
 
 		 412 aa  46.2  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1934 aa  45.8  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>