24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7241 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  44.85 
 
 		 1029 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  47.55 
 
 		 985 aa  732    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  46.04 
 
 		 1043 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  47.72 
 
 		 1034 aa  672    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  100 
 
 		 1067 aa  2006    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  43.59 
 
 		 1084 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  42.54 
 
 		 1030 aa  436  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1202 aa  399  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  36.72 
 
 		 1012 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  37.66 
 
 		 942 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  36.28 
 
 		 946 aa  338  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  35.12 
 
 		 1315 aa  317  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  50.12 
 
 		 1026 aa  296  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  35.75 
 
 		 1017 aa  286  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  39.82 
 
 		 985 aa  257  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  34.93 
 
 		 847 aa  244  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  41.28 
 
 		 1082 aa  237  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  33.5 
 
 		 940 aa  214  9e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  45.92 
 
 		 1284 aa  208  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1306 aa  94.7  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1934 aa  58.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1625 aa  57.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2197  heat shock protein 90  33.33 
 
 		 660 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  30.83 
 
 		 2543 aa  52  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>