23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0850 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  100 
 
 
1017 aa  1893    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  43.95 
 
 
1026 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  38.5 
 
 
1082 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  37.21 
 
 
1084 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  39.85 
 
 
1034 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  38.91 
 
 
1029 aa  364  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  36.2 
 
 
985 aa  348  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  36.03 
 
 
1043 aa  311  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  36.21 
 
 
1067 aa  300  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  37.07 
 
 
942 aa  274  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  34.8 
 
 
1012 aa  262  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  44.92 
 
 
1284 aa  232  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  35.4 
 
 
1030 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  35.64 
 
 
946 aa  224  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  38.4 
 
 
985 aa  213  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  30.55 
 
 
1202 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  32.13 
 
 
940 aa  170  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  35.55 
 
 
847 aa  163  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  36.54 
 
 
1315 aa  156  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  27.12 
 
 
1306 aa  77  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  28.46 
 
 
1934 aa  55.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  32.79 
 
 
2543 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2133  hypothetical protein  22.08 
 
 
554 aa  45.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>