26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  100 
 
 		 946 aa  1769    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  49.19 
 
 		 942 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  38.23 
 
 		 1034 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  37.54 
 
 		 1012 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  36.73 
 
 		 985 aa  365  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  36.62 
 
 		 1084 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  35.66 
 
 		 1043 aa  327  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  36.16 
 
 		 940 aa  320  7e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  38.79 
 
 		 1030 aa  319  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1067 aa  307  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  37.59 
 
 		 847 aa  306  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1029 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  36.57 
 
 		 1026 aa  239  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1202 aa  227  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  34.41 
 
 		 1017 aa  204  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  35.3 
 
 		 1082 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  30.18 
 
 		 1315 aa  154  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  39.77 
 
 		 1284 aa  152  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  36.39 
 
 		 985 aa  120  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1306 aa  73.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0731  hypothetical protein  25.16 
 
 		 583 aa  49.7  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  30.06 
 
 		 624 aa  48.9  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  29.73 
 
 		 412 aa  45.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  22.95 
 
 		 635 aa  45.1  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  27.91 
 
 		 647 aa  44.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1934 aa  44.3  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>