23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1240 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  100 
 
 
940 aa  1790    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  40.49 
 
 
847 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  40.39 
 
 
942 aa  435  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  36.27 
 
 
946 aa  333  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  34.78 
 
 
1012 aa  324  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  35.56 
 
 
1029 aa  308  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  37.3 
 
 
1034 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  34.46 
 
 
1084 aa  297  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  34.37 
 
 
985 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  35.51 
 
 
1030 aa  244  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  31.72 
 
 
1043 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  34.69 
 
 
1026 aa  194  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  30.61 
 
 
1017 aa  147  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  38.84 
 
 
1067 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  34.08 
 
 
1082 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  36.42 
 
 
1284 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  33.78 
 
 
1202 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  35.06 
 
 
1315 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  33.01 
 
 
985 aa  112  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  36.84 
 
 
1306 aa  75.1  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  30.27 
 
 
633 aa  48.9  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  30.05 
 
 
633 aa  46.2  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  31 
 
 
1934 aa  45.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>