285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2197 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2197  heat shock protein 90  100 
 
 
660 aa  1344    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1147  heat shock protein 90  58.68 
 
 
636 aa  777    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1117  heat shock protein 90  60.95 
 
 
668 aa  803    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.775392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0607  heat shock protein 90  61.54 
 
 
637 aa  810    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1549  heat shock protein 90  52.23 
 
 
630 aa  695    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678256  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0752  heat shock protein 90  49.32 
 
 
633 aa  635    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  41.5 
 
 
615 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  41.08 
 
 
627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  40.7 
 
 
646 aa  462  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  39.91 
 
 
614 aa  458  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  40.18 
 
 
628 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0322  heat shock protein 90  40.06 
 
 
624 aa  455  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4301  heat shock protein 90  40.06 
 
 
627 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2376  heat shock protein 90  39.36 
 
 
627 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175392  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  38.45 
 
 
628 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  40.53 
 
 
640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  39.1 
 
 
625 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  38.7 
 
 
629 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  39.14 
 
 
629 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  38.44 
 
 
633 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  39.58 
 
 
652 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  40.4 
 
 
626 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  38.7 
 
 
628 aa  435  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2894  heat shock protein 90  38.57 
 
 
640 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.511153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  36.59 
 
 
645 aa  432  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  38.9 
 
 
622 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  38.69 
 
 
628 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  38.69 
 
 
628 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  35.82 
 
 
644 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  38.9 
 
 
624 aa  429  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  38.9 
 
 
624 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  39.27 
 
 
624 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  39.27 
 
 
624 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  39.27 
 
 
624 aa  424  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  39.27 
 
 
624 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  38.77 
 
 
636 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  39.27 
 
 
624 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  38.67 
 
 
638 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  39.27 
 
 
624 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  39.27 
 
 
624 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2009  heat shock protein 90  39.94 
 
 
613 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18793  predicted protein  39.01 
 
 
750 aa  425  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  39.27 
 
 
624 aa  425  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  36.21 
 
 
644 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  39.27 
 
 
624 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  36.27 
 
 
644 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  39.45 
 
 
624 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  38.08 
 
 
629 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  39.45 
 
 
624 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  38.53 
 
 
629 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  38.28 
 
 
634 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  38.96 
 
 
624 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  39.45 
 
 
624 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  38.86 
 
 
637 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  38.98 
 
 
643 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  39.37 
 
 
632 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  38.83 
 
 
630 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  38.07 
 
 
638 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  39.3 
 
 
624 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  38.55 
 
 
637 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  38.55 
 
 
637 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  39.3 
 
 
624 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  38.7 
 
 
637 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  38.43 
 
 
637 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  39.01 
 
 
637 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  39.01 
 
 
637 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  37.84 
 
 
629 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  39.16 
 
 
637 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  36.57 
 
 
650 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  39.01 
 
 
637 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  36.69 
 
 
635 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  38.02 
 
 
633 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  38.24 
 
 
623 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  37.97 
 
 
634 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  39.37 
 
 
632 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  38.14 
 
 
626 aa  415  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  38.4 
 
 
637 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  39.03 
 
 
632 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  37.71 
 
 
639 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  38.23 
 
 
635 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  39.39 
 
 
634 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  38.83 
 
 
643 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  37.33 
 
 
629 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  38.62 
 
 
630 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  37.78 
 
 
634 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  37.74 
 
 
647 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  37.63 
 
 
634 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  37.96 
 
 
634 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  36.86 
 
 
650 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  37.63 
 
 
634 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  39.52 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  39.67 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  37.73 
 
 
626 aa  411  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3161  heat shock protein 90  37.99 
 
 
625 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0144125 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  39.67 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  39.52 
 
 
632 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  38.07 
 
 
630 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  37.58 
 
 
633 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  39.16 
 
 
632 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  39.16 
 
 
632 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>