288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1803 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  79 
 
 
645 aa  1037    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  75.5 
 
 
650 aa  988    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2214  heat shock protein 90  50.84 
 
 
642 aa  660    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000258546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  100 
 
 
644 aa  1313    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  74.42 
 
 
650 aa  975    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  51.01 
 
 
628 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  51.01 
 
 
628 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  98.6 
 
 
644 aa  1300    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  74.18 
 
 
645 aa  999    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  71.43 
 
 
644 aa  956    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  48.45 
 
 
651 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0243  heat shock protein 90  47.58 
 
 
650 aa  619  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  48.44 
 
 
647 aa  619  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5377  Heat shock protein Hsp90-like protein  50.54 
 
 
657 aa  617  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  48.82 
 
 
636 aa  613  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2657  heat shock protein 90  46.06 
 
 
636 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502417  hitchhiker  0.00031577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  46.82 
 
 
651 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  50.54 
 
 
642 aa  608  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5294  heat shock protein 90  47.35 
 
 
636 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117014  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3387  heat shock protein 90  46.56 
 
 
643 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2474  heat shock protein 90  46.99 
 
 
636 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0369006  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  47.9 
 
 
633 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  47.14 
 
 
634 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  49.06 
 
 
630 aa  596  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  46.77 
 
 
652 aa  594  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  47.8 
 
 
630 aa  592  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  46.11 
 
 
638 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  47.67 
 
 
635 aa  585  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  46.78 
 
 
632 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  47.1 
 
 
638 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  46.38 
 
 
632 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  46.07 
 
 
632 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  46.85 
 
 
634 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  47.1 
 
 
624 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  47.1 
 
 
624 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  46.22 
 
 
632 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  46.22 
 
 
632 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  47.1 
 
 
624 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  46.22 
 
 
632 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  46.38 
 
 
632 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  46.22 
 
 
632 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  46.32 
 
 
624 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  46.22 
 
 
632 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  46.37 
 
 
638 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  46.65 
 
 
639 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  46.95 
 
 
624 aa  582  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  46.95 
 
 
624 aa  582  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  46.95 
 
 
624 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  47.52 
 
 
629 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  48.36 
 
 
623 aa  581  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  48.04 
 
 
623 aa  579  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  46.95 
 
 
624 aa  582  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  47.52 
 
 
629 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  46.95 
 
 
624 aa  582  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  46.95 
 
 
624 aa  582  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  46.95 
 
 
624 aa  582  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  46.95 
 
 
624 aa  579  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  46.95 
 
 
624 aa  581  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  46.33 
 
 
630 aa  581  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  47.21 
 
 
637 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4676  heat shock protein 90  44.61 
 
 
657 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  46.95 
 
 
624 aa  582  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2743  heat shock protein Hsp90  44.72 
 
 
677 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20340  heat shock protein 90  46.83 
 
 
644 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  47.03 
 
 
637 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  46.27 
 
 
637 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  46.17 
 
 
637 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2392  heat shock protein 90  46.21 
 
 
646 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  45.99 
 
 
639 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  45.7 
 
 
637 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  46.17 
 
 
637 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  47.1 
 
 
626 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  46.88 
 
 
637 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  46.88 
 
 
637 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  46.89 
 
 
647 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  46.88 
 
 
637 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  46.41 
 
 
637 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  45.62 
 
 
633 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  46.54 
 
 
634 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  46.22 
 
 
632 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  44.91 
 
 
629 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  45.92 
 
 
632 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  44.6 
 
 
624 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  46.07 
 
 
632 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2894  heat shock protein 90  46.77 
 
 
640 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.511153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  44.6 
 
 
624 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  44.6 
 
 
622 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  46.07 
 
 
632 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  45.37 
 
 
637 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  46.07 
 
 
632 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  46.39 
 
 
628 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  44.27 
 
 
653 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  46.07 
 
 
632 aa  572  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  45.03 
 
 
643 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  45.33 
 
 
634 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  46.65 
 
 
640 aa  569  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  45.34 
 
 
643 aa  572  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  44.11 
 
 
633 aa  568  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  44.39 
 
 
635 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  45.09 
 
 
626 aa  568  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>