287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0607 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2197  heat shock protein 90  61.54 
 
 
660 aa  810    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1549  heat shock protein 90  55.25 
 
 
630 aa  728    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1147  heat shock protein 90  61.32 
 
 
636 aa  815    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30595  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0607  heat shock protein 90  100 
 
 
637 aa  1298    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1117  heat shock protein 90  66.52 
 
 
668 aa  899    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.775392 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0752  heat shock protein 90  51.52 
 
 
633 aa  654    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  43.04 
 
 
646 aa  498  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  42.33 
 
 
627 aa  485  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  41 
 
 
615 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0322  heat shock protein 90  40.26 
 
 
624 aa  462  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  40.03 
 
 
628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  40.12 
 
 
640 aa  452  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  40.73 
 
 
643 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  39.56 
 
 
628 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  40.87 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  40.87 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  40.87 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  40.87 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  40.87 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  40.87 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  40.87 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  40.25 
 
 
630 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  39.13 
 
 
614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  40.58 
 
 
643 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  39.49 
 
 
629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  40.28 
 
 
624 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  40.87 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  40.22 
 
 
626 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  39.07 
 
 
633 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  39.29 
 
 
629 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  40.12 
 
 
624 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  40.28 
 
 
633 aa  445  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  40.06 
 
 
634 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  39.01 
 
 
625 aa  442  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4301  heat shock protein 90  39.49 
 
 
627 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  40.12 
 
 
624 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  40.12 
 
 
624 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  40.12 
 
 
624 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  40.71 
 
 
624 aa  445  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  40.06 
 
 
637 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  39.41 
 
 
622 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  42.47 
 
 
626 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  39.72 
 
 
628 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  39.72 
 
 
628 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  39.41 
 
 
624 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  39.38 
 
 
637 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  39.41 
 
 
624 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  40 
 
 
640 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  39.69 
 
 
637 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  39.51 
 
 
624 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  39.69 
 
 
637 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  35.93 
 
 
644 aa  439  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  39.29 
 
 
637 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  39.29 
 
 
637 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  39.69 
 
 
637 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  38.85 
 
 
629 aa  438  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  39.6 
 
 
637 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  36.35 
 
 
645 aa  439  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  38.1 
 
 
629 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  39.69 
 
 
637 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  35.83 
 
 
644 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  39.19 
 
 
636 aa  435  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  37.84 
 
 
628 aa  433  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  39.44 
 
 
637 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  37.9 
 
 
629 aa  435  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  39.78 
 
 
630 aa  435  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  39.26 
 
 
635 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2376  heat shock protein 90  38.87 
 
 
627 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2009  heat shock protein 90  39.14 
 
 
613 aa  433  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  37.84 
 
 
650 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  38.59 
 
 
639 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  40.09 
 
 
634 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  37.89 
 
 
629 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2894  heat shock protein 90  39.32 
 
 
640 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.511153  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  38.65 
 
 
652 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  40 
 
 
630 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  38.08 
 
 
639 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  37.6 
 
 
623 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  36.22 
 
 
644 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  39.13 
 
 
623 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  38.04 
 
 
637 aa  428  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  39.72 
 
 
632 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  41.05 
 
 
632 aa  429  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  40.27 
 
 
626 aa  428  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  39.07 
 
 
626 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  40.5 
 
 
632 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  38.68 
 
 
634 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  40.5 
 
 
632 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  40.5 
 
 
632 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  40.5 
 
 
632 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  40.97 
 
 
632 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  40.88 
 
 
632 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  40.5 
 
 
632 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  40.5 
 
 
632 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  40.34 
 
 
632 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  40.09 
 
 
632 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  40.88 
 
 
632 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1538  heat shock protein 90  39.46 
 
 
637 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0309955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  40.88 
 
 
632 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  40.5 
 
 
632 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>