295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1195 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  100 
 
 
628 aa  1291    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  70.88 
 
 
625 aa  935    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  68.23 
 
 
629 aa  882    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  76.71 
 
 
627 aa  1026    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  69.86 
 
 
633 aa  904    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  66.83 
 
 
626 aa  846    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  70.83 
 
 
628 aa  907    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  43.82 
 
 
615 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1147  heat shock protein 90  42.05 
 
 
636 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  41.88 
 
 
633 aa  487  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1549  heat shock protein 90  41.97 
 
 
630 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0322  heat shock protein 90  42.86 
 
 
624 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  40.89 
 
 
628 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  40.89 
 
 
628 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  42.34 
 
 
632 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  40.13 
 
 
644 aa  482  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  41.13 
 
 
632 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  41.13 
 
 
632 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  41.23 
 
 
632 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  41.13 
 
 
632 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2376  heat shock protein 90  41.96 
 
 
627 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175392  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2214  heat shock protein 90  40.4 
 
 
642 aa  478  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000258546  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  41.13 
 
 
632 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  41.86 
 
 
632 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0752  heat shock protein 90  40.66 
 
 
633 aa  477  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  41.13 
 
 
632 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  40.8 
 
 
623 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  40.35 
 
 
644 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  40.41 
 
 
626 aa  476  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  41.13 
 
 
632 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  40.28 
 
 
652 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  41.13 
 
 
632 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  41.13 
 
 
632 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  40.5 
 
 
633 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  40.25 
 
 
629 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  40.73 
 
 
629 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  41.23 
 
 
632 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  41.69 
 
 
626 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  41.39 
 
 
632 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2338  ATP-binding region ATPase domain protein  41.74 
 
 
638 aa  474  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.268084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  41.39 
 
 
632 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  40.32 
 
 
645 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  40.42 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  40.42 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  41.2 
 
 
650 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  40.42 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  40.26 
 
 
624 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  40.26 
 
 
624 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  40.26 
 
 
624 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  40.8 
 
 
636 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  40.42 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  41.05 
 
 
624 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  40.42 
 
 
624 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  41.03 
 
 
634 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  40.42 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  40.42 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  40.26 
 
 
624 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  40.42 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  39.06 
 
 
637 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  41.71 
 
 
614 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  40.98 
 
 
644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  40.42 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  40.38 
 
 
634 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  39.94 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  40.31 
 
 
634 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  39.94 
 
 
622 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0243  heat shock protein 90  39.34 
 
 
650 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  40.25 
 
 
635 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19170  heat shock protein 90  41.43 
 
 
635 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000174366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  40.61 
 
 
626 aa  468  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  39.78 
 
 
629 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  40.76 
 
 
632 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  39.94 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  39.63 
 
 
642 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  40.42 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  39.66 
 
 
647 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  40.69 
 
 
623 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  40.13 
 
 
634 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  40.8 
 
 
650 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  40.22 
 
 
634 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  40.28 
 
 
634 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  39.43 
 
 
634 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  39.62 
 
 
629 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  38.56 
 
 
628 aa  465  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  40.47 
 
 
632 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  39.72 
 
 
634 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3387  heat shock protein 90  38.24 
 
 
643 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  39.68 
 
 
637 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  40.38 
 
 
645 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  39.21 
 
 
630 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  40.81 
 
 
633 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  40.47 
 
 
630 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  41.22 
 
 
629 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  39.04 
 
 
640 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  40.06 
 
 
623 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  39.68 
 
 
630 aa  458  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  38.79 
 
 
634 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  38.66 
 
 
651 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2009  heat shock protein 90  40.84 
 
 
613 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  39.11 
 
 
634 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>